順式剪接

內含子的剪接一般都是發生在同一個基因內，切除內含子，相鄰的外顯子彼此連線，稱為順式剪接（cis-splicing）。 I和II型內含子剪接等。注意同反式剪接的區別，反式剪接是指把不同基因或者染色體上的內含子切除並連線外顯子的剪接方式。

概述

在同一個基因內，切除內含子，是相鄰的外顯子相連，叫做順式剪接．將一個信使核糖核酸(mRNA)前體中的各個內含子切除，並將相互鄰近的各個外顯子加以連線，形成成熟的mRNA的過程。在這個過程中，各個外顯子都來自同一個mRNA分子 。但也有另一種情況，即不同基因的外顯子剪接後相互連線，此稱為反式剪接（trans-splicing）。

反式剪接的情況較為稀少，較典型的例子是錐蟲表面糖蛋白基因VSG(variablesurfaceglycoprotein)，線蟲的肌動蛋白基因（actingenes），和衣藻（chlamydomonas）葉綠體DNA中含有的psa基因。