鞭毛運動一些細菌的鞭毛粗細約為10-35納米，藉助它的運動使細菌獲得推動力。一般是許多鞭毛成束地運動，用暗視野照明的顯微鏡可以觀察到。運動類型有螺旋狀波動和圓錐狀旋轉兩種，通常伴有菌體的反向旋轉。前者運動類型，是通過改變鞭毛的方向來改變前進方向，後者則是通過改變旋轉方向來改變前進方向的。關於鞭毛運動的機理，有的認為是由於鞭毛結構蛋白質鞭毛蛋白的排列發生改變造成的，有的則認為是由於鞭毛和菌體在類似軸承的接合部位發生相對旋轉引起的
真核細胞的鞭毛粗細約為0.2微米，有平面波動、立體波動（螺旋狀運動等）、漿式運動（纖毛擺動）等三大運動類型，有時同一種鞭毛也可以有幾種運動類型。例如衣藻（Chlamydomonas）靠2條鞭毛平面遊動（即平面波動）前進，而靠立體波動後退。鞭毛運動不僅可使微小個體遊動，而且是與攝食、消化、排泄有關的體內外各種流動的原動力，如海綿動物的領細胞、腔腸動物的內皮細胞、輪蟲動物的焰細胞、環節動物的有管細胞等都有這種鞭毛運動。真核細胞的鞭毛內部結構與纖毛相同，看來運動機理也基本相同。鞭毛（flagellum）
在某些菌體上附有細長並呈波狀彎曲的絲狀物，少則1-2根，多則可達數百根。這些絲狀物稱為鞭毛，是細菌的運動器官。
從一些原核細胞和真核細胞表面伸出的、能運動的突起。鞭毛較長，數目少；纖毛與鞭毛有相同的結構，但較短，數目多。細菌的鞭毛則有完全不同的結構。
鞭毛一般長約150微米，纖毛5～10微米，兩者直徑相近，為0.01～0.03微米。大多數動物和植物的精子都有鞭毛。精子及許多原生動物都以鞭毛或纖毛為運動器。
具有鞭毛的細菌大多是弧菌、桿菌和個別球菌。
纖毛和鞭毛由3個主要部分組成：中央軸纖絲、圍繞它的質膜和一些細胞質。軸纖絲從纖毛或鞭毛底部的基粒直達頂端，為一束直徑約220～240埃的微管，在基粒底部，則集聚成圓錐形束，深入到細胞質中。
軸纖絲橫切面的微管排列是9+2式，即中心有一對由中央鞘包裹著的微管，外圍環繞以兩兩連線在一起的9組微管二聯體。
基粒的結構象中心粒一樣是9+0型，但它的9組微管是三聯體。纖毛或鞭毛二聯體中的微管，就是從基粒三聯體中兩根微管延伸出來的。
鞭毛和纖毛的運動是由於它們局部彎曲，從基部向頂端波浪式地推進的結果。由於微管二聯體的長度不變，推測這種局部彎曲是由於相鄰的兩根微管二聯體沿長軸滑動引起的。局部滑動所需的能量是由ATP周期性水解提供的。
細菌鞭毛的結構和化學成分都與真核細胞的鞭毛完全不同，不存在9+2的微管型式，而是由2～5條，寬約40～50埃的微絲組成，其蛋白質成分是鞭毛蛋白。除螺旋體外，其他細菌的鞭毛都沒有質膜包被。雖然它們的基底也深入到原生質內的顆粒中，但這種顆粒與基粒毫無相似之處。細菌鞭毛運動的能源不是ATP，據認為是來源於細胞膜的電子傳遞系統產生的一種電化學梯度。
分類：根據鞭毛的數量和部位，可見鞭毛菌分為四類。
化學成分：蛋白質.鞭毛蛋白具有較強的抗原性，可藉此進行細菌的鑑定和分型。
結構：鞭毛自細胞膜長出，游離於菌細胞外，有基礎小體、鉤狀體和絲狀體三部分組成。
功能：鞭毛是細菌的運動器官。鞭毛菌在液體環境下可自由移動，速度迅速。
1. 化學趨向性運動，有助於細菌向營養物質處前進，而逃離有害物質.
2. 與細菌致病性相關
3. 可用以細菌的鑑定和分類
套用
①鑑別細菌
②分血清型.
編輯本段各種不同類型的鞭毛
細菌鞭毛
不同種類的細菌有不同的數目的鞭毛。Monotrichous細菌有一個單一的鞭毛（如霍亂弧菌 ）。 Lophotrichous細菌有多種鞭毛設在細菌同樣的表面上，而協調一致地行動，將細菌進往單一的方向前進。
一些細菌，如selenomonas ，鞭毛是有組織外胞體。
古菌鞭毛
古菌鞭毛，表面看起來類似細菌（或 Eubacterial）鞭毛。
1990年代曾發現了許多古菌和細菌鞭毛詳細的分歧，其中包括：
細菌鞭毛是由一個流動的 H + 離子，古鞭毛幾乎肯定由腺苷三磷酸[ATP]。
細菌細胞中往往有許多鞭毛的細絲，古鞭毛由許多長絲組成一捆。
真核生物鞭毛
真核鞭毛是完全不同於其它從原核生物鞭毛在結構和進化起源。
