由來
在一些網路論壇上看到，有網友活靈活現地說：“一號線每晚收線後會用電腦自動控制列車再走一圈，到站會自動停，開門關門，原因是做交通的好迷信，要搭載建捷運時遇難的工人，所以是靈魂列車。”又有網友稱，連值班的人員也說了，最好不要搭最後一班車。這個說法越傳越廣，以至於心理脆弱的人聞之感到恐怖。
調查
廣州捷運一號線末班車2009年2月8日晚，《新快報》記者前往廣州捷運一號線就靈魂列車一事進行調查。晚11時11分，一列捷運悄然駛入公園前站。捷運運營負責人告訴記者，這就是往廣州東站的尾班車。此前，捷運站一直在廣播往廣州東的運營已經結束，各個站也早早掛牌稱不能往廣州東站了。但是在站台淡定等車的市民，卻有好幾十人。為什麼廣播說沒車，其實還有車呢?這位負責人告訴記者，這也好理解，為了防止旅客買票後來不及上最後一趟車，所以都是提前通知結束運營的，特別是對從其他線轉車來的更要提早謝客。“但是每天坐慣捷運的乘客，都很清楚幾點幾分是最後一趟車，就能掐得很準坐上車”。到了節日，晚上尾班車延長一個小時，依然門庭若市。
記者坐上這趟列車一直到了廣州東站，自此往廣州東站的尾班車結束。隨後，這趟列車來了個折返，再次從廣州東站出發往西朗開去，變身前往西朗的尾班車。記者又上了這趟車，回到了公園前站，已經晚上11時46分了，但是在站台上等候的乘客依然很多，一問，這些乘客都很有經驗，知道這么晚了還有往西朗的尾班車。零時5分，尾班車開到西朗，完成最後一輪的載客任務，然後進廠檢修。整個往返未見任何異常，自不待言。
運營負責人說，例如市民在廣州東站上車，想在公園前轉二號線去三元里，雖然廣州東去西朗方向依然有車，但是晚上行車間隔很長，去到公園前，再去三元里方向的二號線可能已經停運了。為了避免乘客中途沒車坐，回不到家，又要辦理退票，所以可能會有站務員提醒，儘量不要搭最後一班車。但沒想到這么一句溫馨提醒，卻成了造謠者蠱惑人心的所謂“根據”。
闢謠
廣州捷運一號線站台廣州捷運運營負責人稱不僅一號線，其實所有線路都是這樣，嚴格按照運營時刻表走，而在尾班車告示中又稍微提早時間，但不存在神秘加開的“員工專列”。因為各個站的業務量不同，員工們不可能同時下班撤退，所以即使收車後加開幾趟都不可能把員工送完，員工大多數都是自己坐公交回家。如果是在四號線等偏遠站點工作，捷運走了，公車也沒了，有員工就在站里睡覺，第二天再走。
運營負責人說，如果真想看空無一人的“專列”，其實不在晚上，也許在清晨了。比如四號線或三號線，一大早6點鐘坐車的乘客真的少之又少。因此，對於有人在網上大放厥詞，說什麼“靈魂列車”，那只能說這人鬼怪故事看得太多了，或者是生活太無聊了。
