概述
電泳緩衝液是指在進行分子電泳時所使用的緩衝溶液，用以穩定體系酸鹼度。常見的核酸電泳緩衝液有：TAE、TBE、TPE和MOPS等。
作用緩衝液在電泳過程中的一個作用是維持合適的pH。電泳時正極與負極都會發生電解反應，正極發生的是氧化反應（4OH--4e->2H2O+O2)，負極發生的是還原反應（4H++4e->2H2)，長時間的電泳將使正極變酸，負極變鹼。一個好的緩衝系統應有較強的緩衝能力，是溶液兩極的pH保持基本不變。
電泳緩衝液的另一個作用是使溶液具有一定的導電性，以利於DNA分子的遷移，例如，一般電泳緩衝液中應含有0.01-0.04mol/L的Na+離子，Na+離子的濃度太低時電泳速度變慢；太高時就會造成過大的電流使膠發熱甚至熔化。
電泳緩衝液還有一個組分是EDTA，加入濃度為1-2mmol/L，目的是螯合Mg2+ 等離子，防止電泳時激活 DNA酶，此外還可防止Mg2+離子與核酸生成沉澱。
TAE是使用最廣泛的緩衝系統。其特點是超螺鏇在其中電泳時更符合實際相對分子質量（TBE中電泳時測出的相對分子質量會大於實際分子質量），且雙鏈線狀DNA在其中的遷移率較其他兩種緩衝液快約10%，電泳大於13kb的片段時用TAE緩衝液將取得更好的分離效果，此外，回收DNA片段時也易用TAE緩衝系統進行電泳。TAE的缺點是緩衝容量小，長時間電泳（如過夜）不可選用，除非有循環裝置使兩極的緩衝液得到交換。
TBE的特點是緩衝能力強，長時間電泳時可選用TBE，並且當用於電泳小於1kb的片段時分離效果更好。TBE用於瓊脂糖凝膠時易造成高電滲作用，並且因與瓊脂糖相互作用生成非共價結合的四羥基硼酸鹽複合物而使DNA片段的回收率降低，所以不宜在回收電泳中使用。
TPE的緩衝能力也較強，但由於磷酸鹽易在乙醇沉澱過程中析出，所以也不宜在回收DNA片段的電泳中使用。
配製方法
50×TAE Buffer 配製方法：
1。稱量Tris 242g，Na2EDTA.2H2O 37.2g 於1L燒杯中；
2。向燒杯中加入約800ml去離子水，充分攪拌均勻；
3。加入57.1ml的冰乙酸，充分溶解；
4。用NaOH調pH至8.3，加去離子水定容至1L後，室溫保存。
使用時稀釋50倍 即1×TAE Buffer
10×TBE Buffer配製方法：
1。稱量Tris 108g，Na2EDTA.2H2O 7.44g，硼酸55g 於1L燒杯中；
2。加入約800ml去離子水，攪拌均勻；
3。用NaOH調pH至8.3，加去離子水定容至1L後，室溫保存。
使用時稀釋10倍 即1×TBE Buffer
