幹流上游
防城江上游為大菉江和華石江。
大菉江，發源於十萬大山的高雪隘及叫為隘，至蔞朵村會合，流經金龍、那帽、那 照等處，達大菉，再由大菉街南流，經那良坡、成家等處，至合江村前會合那勤江，折向東 流，經華石街達防城，全長48公里，灘多水急，只能行駛“拉灘船”。
華石江。上連大菉、那勤、扶隆江，下接防城江，只能行駛“拉灘船”，
主要支流
大菉江段
那勤江。統合各支流成為那勤江，流至大菉鎮甲水地方與大菉江合流，經華石鎮流入防城江出海。其各支流如下：
防城江大垌江。發源於扶隆隘，至扶隆街與水尾江合流為那勤江。
水尾江。發源於北基村分水坳，至扶隆街與大垌江合流。
那【土並】江。發源於暗街。
石碓溝。發源於白水頂，至潭遜合流那勤江。
西江。發源於白石牙山，流至西江口坡計村合流那勤江。
小峰江。發源於扶隆殿六山，經小峰至桂壩口，與那勤江合流。
上列各支流，水勢湍急，且多石灘，均不能行駛船隻，“拉灘船”僅可抵達那勤圩。
華石江段
支流如下：
華石細江。發源於崩山頂、大龍溝，經合水、灘浪等處，至華石街與大江合流。
丹竹江細江。發源於金頂嶂、三角灶等處，至丹竹江與大江合流。
牛欄江。發源於灘營鄉四和村的平吉，經娥眉月至那納村與大江合流。
沖敏溝。發源於那窿金頂嶂。
楓木坪溝，發源於那裡象村。
防城江段
洗豬河。發源於附城鄉沖稔村的長龍隘。流經掃把壢村、黃崗坳、黃泥溝會合防城江， 全長5公里。昔日圩期，大寺、大直的豬仔挑來防城出賣時，到此河灘用水洗擦乾淨，故名洗豬河。今按諧音改為“洗珠河”。
流域水文
防城江大菉江最深處有那八角潭、觀音廟潭、沖寨灣，水深20米。 在黃竹塘右邊， 有條支流通水營村與主流會合，長3公里多；洲墩左邊有條支流通暗埠口出海，長4公里多。最闊水面400～500米。潮漲時可行駛20～30噸船至防城航運碼頭，潮退時只行小木船，從航運碼頭上至大菉鎮，可通拉灘船。夏季山洪時有暴發，防城街往往被淹。
