工作職能
鄂爾多斯市農業綜合開發辦公室是鄂爾多斯市農業綜合開發領導小組的辦事機構,負責統一管理全市農業綜合開發工作,屬鄂爾多斯市財政局直屬單位。主要職責：（一）貫徹執行國家農業綜合開發方針政策，研究擬定全市農業綜合開發的政策措施。
（二）貫徹落實國家農業綜合開發項目和資金管理制度，起草有關農業綜合開發的地方性法規、規章，負責有關法規、規章實施的組織、指導和協調工作。制定並督促實施全市農業綜合開發項目管理辦法、資金和財務管理制度。
（三）編制全市農業綜合開發中長期規劃和年度計畫，並向上級申報項目。
（四）組織評估、論證各旗區和有關部門農業綜合開發項目的規劃設計、建設規模及投資計畫。
（五）負責對各旗區和有關部門農業綜合開發項目的安排和調整，審批項目實施計畫，並指導、督促農業綜合開發項目實施，組織竣工項目驗收。
（六）組織開展全市農業綜合開發項目後續管理和開發利用工作，督促各旗區運用開發成果，發揮資源優勢，依靠科技進步，加強工程建後管護，不斷最佳化農牧業結構。
（七）辦理全市農業綜合開發資金的預、決算和拔借項目資金，開展農業綜合開發有償資金款的管理，督促各項資金及時如數到位，檢查資金使用情況，按時回收到期有償資金。
（八）負責支持、扶持輻射面廣、帶動力強的重點龍頭項目，發展產業化經營。
（九）負責建設現代化農業園區、高科技示範園區等，組織引進國外、市外和社會資金投入農業綜合開發，積極開展國際、國內合作交流。
（十）組織全市農業綜合開發科技示範和技術培訓，指導各旗區農業綜合開發部門的業務工作。
（十一）負責抓好本部門並指導各旗區農業綜合開發隊伍建設，協調與有關部門的關係。
（十二）承辦市政府及財政局交辦的其他事項。
科室設定
根據上述職責，市農業綜合開發辦內設4個職能科室：（一）綜合科
協助辦領導處理日常工作，負責擬定辦公室機關綜合性的管理規章制度；負責承辦市農業綜合開發領導小組成員會議，負責全市農業綜合開發工作會議 、主任辦公會議及其他綜合性會議的會務工作，並做好各項會議記錄；負責辦內文字綜合、檔案辦理、信息處理和檔案工作；負責辦公室的目標管理工作；負責辦內編制、幹部人事、福利管理工作；負責對外接待及辦內公用房、儀器、設備、車輛管理和後勤服務工作。
（二）計畫業務科
負責編制全市農業綜合開發中長期規劃和年度計畫，指導各旗區編制相應的規劃和年度計畫及各旗區和有關部門農業綜合開發科技項目和現代農業園區、高科技示範園區建設方案，並向上級申報項目；負責國家農業綜合開發項目安排，審查各旗區和有關部門項目實施方案並組織實施；負責督促檢查指導在建項目施工，總結推廣先進經驗，對執行中存在的問題進行研究、處理；負責組織對竣工項目的驗收，指導竣工項目後續管理和結構調整等工作；負責農業綜合開發科技專家的聯絡工作，對有關農業綜合開發項目提供產前、產中、產後服務；負責收集、整理、篩選農業綜合開發擬建項目，組織有關部門和專家對新申報的農業綜合開發擬建項目進行前期考察和評估論證並建立項目庫；負責全市農業綜合開發資金計畫；擬定全市農業綜合開發項目管理辦法；負責全市農業綜合開發統計報表和數字信息工作；研究擬定農業綜合開發項目引資的政策措施，組織開展農業綜合開發方面的國際、國內合作與交流。
（三）財務科
負責辦公室各項經費和固定資產的管理；組織擬定資金和財務管理制度，負責全市農業綜合開發資金的預決算，按工程進度和質量拔借項目資金，指導各旗區開展農業綜合開發財務核算和項目資金的預決算；督促農業綜合開發各項資金及時如數到位，檢查資金使用情況；承辦辦內業務經費的帳務處理工作；負責管理、回收農業綜合開發有償資金，組織收集集體、個人及其他渠道自籌資金安排使用情況。
（四）評審中心
協調有關部門、科研院所參與開發，開展農業綜合開發評審，農業綜合開發項目中期檢查與竣工驗收，引資項目執行情況監督管理，農業綜合開發信息系統建設與管理，相關業務培訓與諮詢服務。
