迴文序列

迴文序列

迴文結構(palindrome structure) 雙鏈DNA中的一段倒置重複序列,當該序列的雙鏈被打開後,可形成局部"十"字形結構.這段序列被稱為迴文序列. 5′CTTATATAAG3′3′GAATATATTC5′形成髮夾結構,常見於基因的調控區和特異蛋白結合區。

釋義

迴文結構序列是一種鏇轉對稱結構,在軸的兩側序列相同而反向。當然這兩個反向重複序列不一定是連續的。短的迴文結構可能是一種特別的信號,如限制性內切酶的識別序列。較長的迴文結構容易轉化成髮夾結構,此種結構的形成可能有助於DNA與特異性DNA結合蛋白結合。

特徵與功能

迴文序列的一般特徵: 有對稱軸 ; 是自我互補的序列 ; 兩條鏈從 5 ‘ 到 3 ‘方向的序列一致 ; 是 II 類限制酶的識別序列 ;是某些蛋白的識別序列 ; 是基因的旁側序列

迴文序列迴文序列

結構

其特點是在該段的鹼基序列的互補鏈之間正讀反讀都相同(並非在同一條鏈上正讀反讀)。

在雙鏈中,形成十字架結構在雙鏈中,形成十字架結構

例如:

5' GGTACC 3'

3' CCATGG 5'

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