生物大分子的X射線晶體學

生物大分子的X射線晶體學

《生物大分子的X射線晶體學》作 者是柯衡明,陳玉祥,蔡繼文,由 化學工業出版社 於 2010年1月1日出版,本書主要介紹了生物大分子X射線衍射晶體學的基本原理,包括蛋白質的純化和晶體的培養、晶體的表征、X射線衍射原理、蛋白質晶體結構分析的主要方法和手段的內容。

基本信息

內容簡介

生物大分子的X射線晶體學生物大分子的X射線晶體學
本書主要介紹了生物大分子X射線衍射晶體學的基本原理,包括蛋白質的純化和晶體的培養、晶體的表征、X射線衍射原理、蛋白質晶體結構分析的主要方法和手段、重原子衍生物的製備、分子置換法解析晶體結構、蛋白質模型的構建、電子密度圖的解析以及結構精修等。本書結合第一作者柯衡明教授多年從事蛋白質晶體結構分析所積累的經驗,總結了在蛋白質純化、蛋白質及其重原子衍生物晶體的培養、數據處理和結構分析過程中常見的問題和解決方法。

本書可作為從事結構生物學研究的科研工作者的參考書和研究生的教材。

目錄

 1大分子結構測定概述

參考文獻

2生物大分子的結晶

2.1 結晶的理論基礎

2.2 影響結晶的因素

2.3 結晶方法

2.4 結晶的實用心得

2.5 結晶過程的自動化

參考文獻

3晶體的表征

3.1 晶系

3.2 對稱性與空間群

3.3 對稱性的矩陣表示

3.4 晶胞的不對稱單位

3.5 倒易晶

參考文獻

4X射線衍射原理

4.1 X射線的產生

4.2 一個電子的散射

4.3 一個原子對X射線的散射

4.4 一個分子對X射線的散射

4.5 衍射的中心對稱性

4.6布拉格衍射定律

4.7 愛瓦爾德衍射球

4.8 衍射空間的對稱性

5帕特森函式

5.1 相角問題簡介

5.2 帕特森函式

5.2.1 帕特森函式的理論基礎

5.2.2 帕特森圖的解析

參考文獻

6同晶置換

6.1 同晶置換理論

6.2 相角計算

6.3 重原子的最小二乘法精修

6.4 重原子最大機率精修

參考文獻

7多波長反常衍射

7.1 多波長反常衍射的原理

7.2反常散射的差異

7.3吸收限

7.4 MAD的實驗設計

7.5 MAD中相位的計算

參考文獻

8相位最佳化

8.1 溶劑平滑法

8.2直方圖匹配

8.3 局部或非晶體學對稱性平均

8.4 相位組合

參考文獻

9重原子衍生物的製備

9.1 同晶現象

9.2 溶液中影響重金屬結合的原因

9.2.1 pH值的影響

9.2.2 緩衝液

9.2.3 沉澱劑

9.2.4 重金屬濃度、浸泡時間和溫度

9.3 重金屬概論

9.3.1 汞

9.3.2 鉑、金、鈀

9.3.3 銥和鋨

9.3.4鈾酸鹽和陽離子試劑

9.3.5 氙

9.4 MAD實驗用的重原子

9.5 硒代甲硫氨醯蛋白質突變體的製備

9.6 硒代甲硫氨酸內切酶Nae Ⅰ表達的實驗設計(Ke’s Lab,UNC,August 1998)

9.6.1 大腸桿菌細胞的增殖

9.6.2 改良的M9培養基的製備

參考文獻

10分子置換法

11蛋白質的結構

12電子密度圖的解析與模型構建

13結構精修

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