調節開花期
玉米由於單性花，在調節開花期方面，必須使母本的雌穗和父本的雄穗的花期一致。可用分期播種的方法調節父、母本的花期。
玉米雜交選株
父、母本均應選擇生長健壯、無病蟲害和具有本品種典型性狀的植株，作為雜交對象。
玉米雜交套袋隔離
玉米雜交當母本植株的雌穗已經露出而沒有伸出柱頭以前，用牛皮紙袋套好雌穗。當母本雌穗開始抽出柱頭時，要在當天用牛皮紙袋套在父本植株的雄穗上，雌、雄穗的紙袋，要用細繩或回形針紮緊，以免脫落。
采粉
從上述玉米的開花習性中可以知道，其雄穗在始花後的第2～4天內開花最多，進入盛花期，一天中開花最多的時間是上午8～10時，而此時花粉的生活力也最強；雌穗在始花後的第2～4天，處於盛花期，柱頭已基本抽齊。因此，采粉時間應選擇父、母本的盛花期、並選擇上午8～10時進行采粉。採集花粉時，將父本雄穗稍稍下彎，輕輕抖動，用人工輔助授粉器盛接花粉、采粉時要防止其它品種的花粉混入。
人工輔助授粉器是用光滑的厚紙製成1個圓錐形的紙筒，用厚紙作紙蓋蓋住下口，另外用細鐵絲網做成1個篩子，平放於低筒內。採集的花粉可通過篩子均勻授到柱頭上。
授粉
授粉時，先取下雌穗上的紙袋，立即用人工輔助授粉器的下口對準雌穗的柱頭，輕輕抖動授粉器，使花粉落在柱頭上。
授粉後，仍用原來的紙袋將雌穗套好，但應在袋頂和穗頂之間留出一定的距離，以防止因果穗伸長而頂破紙袋。紙袋套好後，應在雌穗基部拴上紙牌（或塑膠牌），寫明雜交組合、授粉日期和操作者姓名等項內容。
收穫
玉米雜交母本果穗成熟後，應連同紙牌（或塑膠牌）一起單獨收穫，並單獨保存，供來年播種檢驗雜交是否成功。
