定義
激活蛋白轉錄過程
細菌RNA聚合酶通過σ因子來達到識別基因的目的，其中很多應激反應基因依賴於σ54因子，它們能和啟動子DNA結合形成一個穩定的封閉複合物，這對於轉錄過程很重要。轉錄的開始需要結合於轉錄起始位點上游的激活蛋白驅動的ATP水解。在2008年11月7日出版的《分子細胞》（MolecularCell）上，一組來自英國帝國理工學院的科學家提出了形成以上封閉複合物的結構基礎，並分析了激活蛋白啟動轉錄過程的機制。
轉錄過程的開始需要將一種包含RNA聚合酶（RNApolymeraseRNAP）以及雙鏈啟動子DNA的封閉啟動子複合物轉變為開放型複合物，因為只有發生這一過程，生物酶才能與單鏈形式的DNA模板發生作用。而細菌RNAP和主要的σ因子σ54形成的複合物是封閉型的，只有通過依賴於ATP水解的激活蛋白重塑作用，它們才能變為開放複合物。以上重塑作用使DNA解鏈，促使封閉複合物發生轉變。
在本期刊物的封面文章中，Bose等科學家提出了細菌RNAP與σ54結合產生的複合物的冷凍電子顯微鏡的重建結果，除此之外他們也得到了RNAP-σ54複合物與一個AAA+激活子結合的重建結果。結合光交聯數據並找到啟動子DNA與這一複合物結合的位點，研究小組解釋了封閉型RNAP-σ54複合物為何無法與DNA模板結合，此外，科學家們還提出激活子的結合導致的結構變化是如何形成構象改變的，這最終將導致開放型複合物的形成。
