泉州高鐵南站線路自既有福州站引出，利用在建福平鐵路至福州南站北端，通過聯絡線引入福州南站新建高速場，上跨既有福州南動車所，跨越烏龍江，下穿在建福平鐵路，上跨瀋海高速、既有福廈鐵路、在建福州東部繞城高速，折向西以隧道形式穿越山體，繞避西溪水庫水源保護區和烏仔底水庫的一級水源保護區，至菜安村出隧道後依次上跨324國道和瀋海高速公路，折向南行，由顯鏡宮和美佛兒學校間空地通過，在石竹路南側設福清西站，出站後第二次上跨瀋海高速，繞經小往村東側山地，至聯華村七畝園附近第三次上跨瀋海高速，經由建新村後以隧道的形式穿越山體繞避溪頭亭水庫進入莆田市;並行既有福廈鐵路西側前行，跨越瀋海高速和木蘭溪，沿瀋海高速和既有福廈鐵路之間的狹窄通道至莆田站並站，出站後依次跨越城港大道、莆秀高速、湄洲灣港口支線鐵路和既有福廈鐵路，然後折向西南跨越湄洲灣進入泉州市境內;從西北側繞過泉港化工園區，至泉港區前黃鎮附近設泉港站，出站後跨越漳泉肖鐵路，後並行漳泉肖鐵路東側前行，上跨斗尾疏港高速，下穿泉州繞城高速，並行於泉州灣公路橋下游跨越泉州灣，上跨石獅沿海大道，兩跨泉州繞城高速，於靈秀山西側設泉州南站，出站後上跨圍頭疏港高速，由西側繞避五里工業園區、溪邊水庫水源保護區和草洪塘水庫的一級水源保護區，並行城市聯盟高速公路橋上游跨過安海灣，折向西北繞避取石區，後折向西依次跨過G324、瀋海高速和既有福廈鐵路後進入廈門市境內;並行既有福廈鐵路至廈門北站北側新建高速場，於永祥小區與既有福廈鐵路間穿過，上跨集美北大道，並行瀋海高速北側西行，進入漳州市;後折向西南，上跨廈蓉高速、瀋海高速和鷹廈鐵路，並行廈深鐵路跨越九龍江，後以聯絡線方式跨越廈深鐵路和在建廈漳同城大道引入漳州站。
未來福廈高鐵客運專線的通車，將會有效緩解福廈鐵路的運營壓力。同時隨著高鐵泉州南站的建成，也將對台商區產生巨大的影響。每小時350公里的運營時速，意味著從台商區未來10分鐘即可到達廈門，半小時到達福州，8小時直通首都北京，時間直線縮短4小時！台商區也將加深與閩南城市之間的“互動”，與海峽西岸各主要城市更緊密的連線，增加物流、客運服務質量，共築東南沿海地區大都市圈。
規劃線路：福州-莆田-泉州-廈門-漳州
最新進展：完成項目預可研審查，重點控制性工程今年底動工，計畫明年全面開工
●東起福州市，接入京福高鐵，沿線經福州、莆田、泉州至廈門市並延伸到漳州市，線路全長約254公里。
●按350公里/小時的速度標準規劃建設，福廈間將形成一小時經濟圈，遠期預測客運量約3500萬人次。
據悉，該項目重點控制工程將在2016年底全線動工，有望於2019年竣工。
