主要症狀
小球菌核病和小黑菌核病症狀相似，侵害稻株下部葉鞘和莖稈，初在近水面葉鞘上生褐色小斑，後擴展為黑色縱向壞死線及黑色大斑，上生稀薄淺灰色霉層，病鞘內常有菌絲塊。小黑菌核病不形成菌絲塊，黑線也較淺。病斑繼續擴展使莖基成段變黑軟腐，病部呈灰白色或紅褐色而腐朽。剝檢莖稈，腔內充滿灰白色菌絲和黑褐色小菌核。侵染穗頸，引起穗枯。
褐色菌核病在葉鞘上形成橢圓形病斑，邊緣褐色，中央灰褐，病斑常匯合呈雲紋狀大斑，浸水病斑呈污綠色。莖部受害褐變枯死，常不倒，後期在葉鞘及莖稈腔內形成褐色小菌核。球狀菌核病使葉鞘變黃枯死，不形成明顯病斑，孕穗時發病致幼穗不能抽出。後期在葉鞘組織內形成球形黑色小菌核。
灰色菌核病葉鞘受害形成淡紅褐色小斑，在劍葉鞘上形成長斑，一般不致水稻倒伏，後期在病斑表面和內部形成灰褐色小粒狀菌核。
形態特徵
小黑菌核病菌Helminthosporiumsigmoideumvar.IrregulareCrall.EtTull.（=NakateaeirregulareHara）稱稻卷芒雙曲孢霉，屬半知菌亞門真菌，是小球菌核病菌的變種.有性態尚未發現。分生孢子梗在病組織或浮於水面菌核上形成，單生或數枝簇生，分生孢子紡綞形，彎或呈“S”形，具隔膜3～4個，大小50～74×8～12（μm），頂細胞上生卷鬚狀長絲。菌核大小約0.15mm，深橄欖色。
小球菌核病菌H.SigmoideumCav.=N.Sigmoidea（Cavara）Hara，有性態MagnaporthesalviniiCatt.KrauseetWebster。稱稻小球腔菌，屬子囊菌亞門真菌。我國尚未發現。分生孢子梗深褐色，不分枝，上生新月形分生孢子，大小41～63×11～15（μm），有隔膜0～4個，多3隔，中央兩細胞暗褐色，兩端細胞色淡。菌核球形，大小約0.25mm，菌核有內外兩層，外層色黑，內層色淡褐。
褐色菌核病菌Sclerotiumoryzae-sativaeSaw.稱稻小核菌，屬半知菌亞門真菌。菌核數量較少，球形，卵圓或圓柱形，深褐色，大小0.3～2mm，表面粗糙，無內外層之別。
球狀菌核病菌SclerotiumhydrophilumSacc.稱喜水小核菌，屬半知菌亞門真菌。菌核球形，褐至黑色，大小0.25～0.68mm，分內外兩層，生於葉鞘組織內，但較少。
黑粒菌核病菌HelicocerasoryzaeLinderetTullis稱稻卷角霉，屬半知菌亞門真菌。菌核鼠糞狀，黑色，大小0.14～0.24×0.06～0.14（ram），生於葉鞘組織內。
灰色菌核病菌SclerotiumfumigatumNak.exHara.稱灰色小核菌，屬半知菌亞門真菌。菌核球形至橢圓形，灰色或灰褐色，大小0.3～1.5mm，生於葉鞘表面。
赤色菌核病菌RhizoctoniaoryzaeRyk.EtGooch稱稻枯斑絲核菌，屬半知菌亞門真菌。菌核極少，淡紅色，短柱或扁平，大小0.4～1.0mm，生於葉鞘組織內或葉鞘間。
褐色小粒菌核病菌SclerotiumorizicolaNakataetkawam稱稻生小核菌，屬半知菌亞門真菌。菌核球形或不規則形，深紅褐色，大小0.07～0.10mm，生於葉鞘組織內。
傳播途徑
發病較重的主要是小球菌核病和小黑菌核病，主要以菌核在稻樁和稻草或散落於土壤中越冬，可存活多年。當整地灌水時菌核浮於水面，粘附於秧苗或葉鞘基部，遇適宜條件（17℃）菌核萌發後產生菌絲侵入葉鞘，後在莖稈及葉鞘內形成菌核。有時病斑表面生淺灰霉層，即病菌分生孢子，分生孢子通過氣流或昆蟲傳播，也可引起再侵染。但主要以病健株接觸短距離再侵染為主。菌核數量是次年發病的主要因素。
發病條件
病菌發育溫限11～35℃，適溫為25～30℃。雨日多，日照少利於菌核病發生。深灌、排水不好田塊發病重，中期烤田過度或後期脫水早或過旱發病重。施氮過多、過遲，水稻貪青病重。單季晚稻較早稻病重。高稈較矮稈抗病，抗病性糯稻大於秈稻大於粳稻。抽穗後易發病，蟲害重傷口多發病重。
防治方法
（1）種植抗病品種 因地制宜地選用早廣2號、汕優4號、IR24、粳稻184、閩晚6號、倒科春、冀粳14號、丹紅、桂潮2號、廣二104、雙菲、珍汕97、珍龍13、紅梅早、農虎6號、農紅73、生陸矮8號、粳稻秀水系統、糯稻祥湖系統、早稻加秈系統等。
（2）減少菌源。病稻草要高溫漚制，收割時要齊泥割稻。有條件的實行水旱輪作。插秧前打澇菌核。
（3）加強水肥管理，淺水勤灌，適時曬田，後期灌跑馬水，防止斷水過早。多施有機肥，增施磷鉀肥，特別是鉀肥，忌偏施氮肥。
（4）藥劑防治。在水稻拔節期和孕穗期噴灑40%克瘟散（敵瘟靈）或40%富士一號乳油1000倍液、5%井岡黴素水劑1000倍液、70%甲基硫菌靈（甲基托布津）可濕性粉劑1000倍液、50%多菌靈可濕性粉劑800倍液、50%速克靈（腐霉劑）可濕性粉劑1500倍液、50%乙烯菌核利（農利靈）可濕性粉劑1000～1500倍液、50%異菌脲（撲海因）或40%菌核淨可濕性粉劑1000倍液、20%甲基立枯磷乳油1200倍液。
