楊菊賢從1983年開始從事心理行為因素與心血管疾病的相關性研究。1992年創辦《中國行為醫學雜誌》,任總編輯,同年任中華醫學會全國行為醫學專業委員會代主委,1996年當選第二屆全國主任委員迄今。1996年獲國家教委科技進步三等獎。1999年出席海峽兩岸全科醫學學術交流會,作大會主題報告。2000年10月獲全國“吳孟超杯――突出貢獻獎”,以表彰他將哲學與心理學套用於臨床醫學取得的成績。2002年獲“21世紀養生保健傑出科技工作者稱號”。2009年11月在第十一次全國行為醫學學術會議上由“首屆中華行為醫學獎審定委員會”授予“中華行為醫學終身成就獎”。
已出版專著《實用心身疾病學》、《實用心律失常學》、《康復心臟學》、《行為醫學研究》、《中華現代行為醫學》、《冠心病的養生與自我保健》等7本,發表論文200餘篇。1997年獲國務院政府特殊津貼。
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