歷史沿革
新疆醫科大學藥學院的前身是創建於1978年的新疆醫學院藥學系。1998年，為加快新疆醫學高等教育事業的發展，適應教育改革的需要，原新疆醫學院與原新疆中醫學院合併建立新疆醫科大學，同年藥學系更名為藥學院，它的成立標誌了新疆高等藥學教育進入新的發展階段，是新疆藥學發展史上的重要里程碑。
藥學院經過二十七年的發展，已由當初招生規模小、專業設定單一、科研水平尚屬起步階段的小系逐漸發展到今天這樣的中等招生規模、專業方向多樣(2004年新增了臨床藥學、藥品行銷兩個專業方向)、教學與科研並重的、能夠培養高級藥學人才（碩士、博士）的藥學院。建系初，藥學系每年招生32人，民漢班隔年招生，在校學生人數只有128人。隨著社會對藥學人才需求量的增加，藥學院一方面增加專業設定，在擴大藥學專業招生的同時，還不定期的招收了醫院藥劑、藥品行銷、藥物新劑型等專業的學生；另一方面藥學院遵循“穩定本科教學、加快發展研究生教學和重視成人教育和繼續教育”的原則，有計畫的擴大辦學規模，尤其是研究生培養工作得到飛速的發展。
內設機構
藥學院下設六個教研室和分析測試中心。六個教研室是藥化/有機教研室、藥劑/物化教研室、藥分/分析/教研室、天藥/生藥教研室、藥理教研室和化學教研室。承擔了藥學專業本、專科的藥理學、藥劑學、藥物分析、天然藥物化學、藥物化學、有機化學、物理化學、藥用植物學、醫用化學、基礎化學、分析化學、無機化學、生藥學、藥事管理、新藥設計與研究（選修）、體內藥物分析（選修）、無機藥物化學（選修）、毒物分析（選修）、波譜學（選修）、藥學英語（選修）等課程的教學和實驗指導任務；此外，還為研究生班開設了近代儀器分析、新劑型研究與評價、生物藥劑學、波譜學、分子藥理學、心血管藥理學、免疫藥理學、神經藥理學、日本語等課程；為基礎醫學院、預防醫學院及中醫學院開設了基礎藥理學、臨床藥理學、衛生化學、中藥藥理學等課程；2003年開始承擔留學生的無機化學、有機化學和藥理學等課程的教學和實驗，年教學總工作量達6000學時以上。藥學院教研室教師均能在主講一門藥學專業主幹課程的基礎上，還能兼講一門或幾門其他課程，做到了所謂“一人多課制”和“一課多人制”，為實現學科之間互相交叉滲透邁出了重要一步。
分析測試中心建立於2001年5月，2003年批准為校級重點實驗室。主要從事中、西藥物的分析測試，服務於校內的教學和科研，同時也向校外開放服務，擁有大型LC-MS、HPLC、GC、UV、IR、600兆NMR等儀器。日元貸款儀器如噴霧乾燥儀、低溫冷凍乾燥儀、製備高效液相色譜儀、傅立葉變換紅外光譜儀、數字全自動旋光儀、超臨界流體萃取儀、離子色譜儀等不久可到位使用。
學生構成
學院在院學生總數為751人，其中：全日制本科生538人，占71.6%；全日制本科生中少數民族學生315（58.6%）。業餘本、專科生134人，占17.8%；研究生79人，占10.5%。學生規模和層次比例的增長，體現了學院“規模、結構、質量、效益”協調發展的指導思想。在今後的五年里，將繼續發展研究生教育，為新疆培養更多高學歷、高素質的藥學人才。
師資力量
藥學院擁有藥學博士後流動站（在站3名，出站1名），一個博士點（藥理），5個碩士點（藥理學、藥物分析、藥劑學、生藥學、藥物化學）。有博士導師9人，碩士導師24人,每年可招博士生9～16人；碩士研究生20～30人。學院師資力量雄厚，現有教職工95人。教師87人，其中教授13人，占教師隊伍的14.9%；副教授33人，占教師隊伍的37.9%；講師33人，占教師隊伍的37.9%；教師中具有博士學歷的15人。具有碩士學歷的教師有42人, 占教師隊伍的48.3%,碩士以上學歷的教師占教師隊伍的65.52%（57/87）。少數民族教師35人（40.2%），其中研究生以上學歷19人（54.3%）。20餘人次受到國家、自治區和醫科大學表彰的教師。其中，有四位博士生導師被國務院授予有突出貢獻、享受政府特殊津貼的優秀專家光榮稱號，並獲自治區優秀專家榮譽稱號；一位教師獲得自治區名師獎；三位教師被授予自治區優秀教師稱號；四位中青年教師分別獲中國大學生跨世紀發展獎學金、自治區第三屆優秀大中專畢業生、全國青年科技之星、霍英東優秀青年教師等榮譽稱號。
科研力量雄厚，三年來獲得各類科研資助項目34項，其中國家自然科學基金項目5項、國家科技部西部開發專項項目1項、國家十五專項課題1項，共獲科研經費850萬餘元。取得各類科技成果獎25項，獲中華醫學獎1項，自治區科技進步獎7項，發明專利13項，在各類醫學刊物上發表論文192餘篇。SCI收錄26篇，引用10篇。
