北京市信息化工作辦公室既是北京市信息化工作領導小組的辦事機構，又是負責本市信息化和無線電行業管理工作的市政府工作部門。內設綜合（人事）處、監察處、發展計畫（法規）處、總體技術與標準處、推廣套用處、網路安全管理處、電子政務與信息資源處，公共信息管理處。
主要職責
（一）貫徹執行國家信息化工作的方針、政策和法律、法規，研究起草本市信息化工作方面的地方性法規、規章草案，以及發展規劃、總體規劃、年度計畫。
（二）審核各部門、各區縣、各行業的信息化發展規劃及實施計畫，並督促實施；負責審核本市重大信息化建設工程項目，並監督實施。
（三）統籌規劃本市公用通信網、廣播電視網和部門專用通信網；聯繫與國家通信主幹網、軍工部門及其他部門專用通信網方面的工作。
（四）研究提出本市有關信息化建設技術標準的意見；負責組織本市重大信息化建設工程技術論證、評估驗收工作。
（五）負責本市電子信息技術的推廣套用工作：組織協調全市信息資源的開發利用；負責電子信息技術推廣套用的貸款和信息化建設專項資金的管理、監督工作。
（六）負責本市信息行業的執法監督；負責基於網路的信息服務行業和信息系統集成單位的資質認證；負責本市國家機關在國際網際網路上註冊域名的審核工作；組織建立本市計算機信息網路系統的安全認證體系。
（七）負責本市信息化領域軟課題的立項和驗收；指導本市信息化人才的教育培訓和信息化宣傳工作；負責本市信息化對外交流和合作工作。
（八）負責本市無線電管理工作。
（九）承辦市政府交辦的其他事項；承擔北京市信息化工作領導小組的具體工作。
綜合處
負責本機關的政務工作，負責公文的處理、信息、宣傳、檔案、保密、外事、信訪、財務、議案、建議和提案工作；負責重要檔案和會議決定事項的督查工作；負責機關及所屬單位的人事、機構編制管理工作。
負責與區、縣和各委辦局信息化工作機構的聯繫工作；負責與國信辦、信息產業部等國家機構和外省市信息化機構聯繫工作。聯繫所有直屬單位。
監察處
做好黨風廉政建設和反腐敗工作。落實"懲防體系"建設的各項任務，抓好反腐倡廉工作部署和任務分解；做好廉政教育和廉潔自律工作。對黨員幹部進行黨性、黨風、黨紀、法律、法規和紀律的宣傳教育；落實黨風廉政建設責任制實施辦法，組織領導幹部與分管部門簽定黨風廉政責任書，負責信息化基本建設項目招標評標程式的監督工作和辦系統內部審計工作；監督檢查執行黨的路線、方針、政策，遵守國家法律、法規，執行市委、市政府決定、命令的情況；受理對領導班子和黨員幹部違反黨紀政紀行為的舉報；參與調查領導幹部違反黨紀政紀的案件；負責調查處級幹部違反黨紀政紀的案件；受理黨員不服黨紀、政紀處分的申訴。
技術與標準管理處
負責本市信息化建設方面的技術與標準的管理工作；負責組織制定和修訂信息建設方面的總體架構和技術標準，並組織實施；研究提出信息通信新技術套用的政策建議；負責組織重大信息化工程項目的技術論證、驗收評估以及相關的技術監督工作。
