優點
抗體是一種複雜配體，其優勢在於能以高親和力特異結合抗原的某一小部分。一些表位具有一條或幾條多肽鏈上互不相鄰的區域摺疊形成的複雜拓撲結構，而另一些表位可能只含有單一肽鏈上相互毗鄰的胺基酸段。某些蛋白質，雖然整體上可能摺疊不正確或沒有活性，但仍可以形成上述這種局部表位，保持一部分免疫學反應性。正因為抗體具有可和摺疊不正確的或變性的蛋白質所包繞的相關表位相結合的能力，使這種檢測方法更加簡單、可靠 。
影響因素
影響免疫學檢測的因素很多，但最重要的是抗體的質量。就抗體而言，除高滴度、高特異性外，如何最大限度降低非特異性反應是成功的關鍵。由於動物血清中含有多種抗大腸桿菌的抗體，克服假陽性的方法之一就是選擇適當的抗體滴度，這需要一系列的實驗來確定。一般而言，單抗只針對某一抗原決定簇，檢測的極限要低得多。
要注意的是，如同其它基於結構的檢測方法一樣，以抗體探針為基礎的免疫學篩選結果的確證從來不是絕對的，並且它所識別的蛋白質表位通常也不完全肯定，因此有些時候對所得到的陽性結果需要進行進一步的確證，如驗證目的蛋白的生物學活性、比較該蛋白的胺基酸序列、表明得到的陽性蛋白能夠阻斷目的蛋白純品與特異抗體間的相互作用等，但無論採用哪種方法，都必須是不依賴於當初鑑定時所使用免疫學製劑的獨立方法 。
半導體量子點-Smad2單克隆抗體探針檢測
半導體量子點和單抗偶聯後能作為一種特異的分子探針用於分子水平的細胞成像檢測，這為半導體量子點單抗螢光探針用於活細胞內信號通路的研究和對蛋白質分子進行實時、原位、長時間可視化動態觀察檢測提供了科學實驗依據 。
