微衛星

20世紀80年代後期，Marshfield醫學研究基金會(Marshfield Medical Research Foundation)的James和俄勒岡健康科學大學(Oregon Health Sciences University )的Wis等人分離出來一種比小衛星DNA具有更短重複單元的衛星DNA，被稱為微衛星DNA，又被稱作短串連重複(Short Tandem Repeats, STRs)或簡單重複序列(Simple Sequence Repeat, SSRs), 每單元長度在1～6bp之間根據重複單元的構成與分布，微衛星DNA序列被分為3種類型：單一型(pure),複合型(compound)和間斷型(interrupted)

微衛星 Microsatellite

基因組中一段簡單重複序列, 例如:

單一型:ATATATATATATATATATATATAT

複合型: ATATATCACACACACACACAC

間斷型: ATATATCA ATATATCA ATATATA

微衛星DNA符合孟德爾遺傳模式，共顯性表達，廣泛分布於真核生物的基因組中，包括編碼區和非編碼區.研究表明，可能是DNA複製過程中的“鏈滑”(strand slippage)現象造成微衛星DNA多態性信息容量(polymorphic information content, PIC)較高.由於微衛星具有數量多、在基因組內分布均勻、多態性信息豐富、易於檢測等優點被作為優良的遺傳標記(genetic marker)而得到廣泛套用。

基序 Motif

微衛星中重複單元（Motif）。例如ATATATATATATATATATATATAT序列中，AT就是該序列的重複單元，在重複單元的劃分上，一般認為：

CA = AC = GT = TG

AGC = GCA = CAG = GCT = CTG = TGC