計算方法
國家各省起付線不一，現以其中之一例舉說明：
參合農民住院補償實行分級分段補償的方法，即：參合農民住院補償分鄉鎮衛生院、縣級醫院和縣外醫院三級，其中各級醫院住院費用又分段按比例補償。具體規定如下：
鄉鎮衛生院：住院醫藥費起付線為50元，即50元以下部分不予補償，50元以上1000元以下（含1000元）部分補60%，1001元至2000元部分補償比為65%，2001元以上補償比為70%。如：一位參合農民因闌尾炎在某衛生院住院治療花費2000元，剔除未進入補償範圍的費用200元，實際可以參與補償的醫藥費用是2000元—200=1800元 ，總補償金額計算方式為： （1000—50）×60% =570元 （1800—1000）×65% =520元 570+520=1070元 該參合農民總補償金額為1070元
縣級醫院：住院醫藥費用起付線為300元，即300元以下不予補償，301至1000元補償比為40%，1001至2000元補償比為45%，2001至5000元補償比為50%，5001元以上補償比為55%。如：一位參合農民在家務農不幸腦外傷在縣人民醫院住院治療花費10000元，剔除未進入補償範圍的費用500元，實際參與補償的醫藥費為10000—500=9500元，總補償金額計算方式為： （1000—300）×40%=280元 （2000—1000）×45%=450元 （5000—2000）×50%=1500元 （9500—5000）×55%=2475元 該參合農民總補償額為280+450+1500+2475=4705元
縣外醫院：住院醫藥費用起付線為1000元，即1000元以下部分不予補償，1001至2000元補償比為20%，2001至5000元補償比為25%，5000元以上補償比為30%。如：參合農民因胃出血到省人民醫院手術治療花費18000元，剔除未進入補償範圍費用1000元，實際參與補償的醫藥費為18000—1000=17000元，總補償金額計算方式為： （2000—1000）×20%=200元 （5000—2000）×25%=750元 （17000—5000）×30%=3600元 該參合農民總補償金額為200+750+3600=4550元
