辦學理念
北京大學元培學院改革開放以來，北京大學不斷開展人才培養模式的改革和探索。上世紀80年代後期，學校在調查研究的基礎上提出了"加強基礎，淡化專業，因材施教，分流培養 "的十六字教學改革方針。
在北大跨入第二個百年的歷史時刻，國家制訂了科教興國的發展戰略，發出了創建世界一流大學的戰略號召。這為北京大學的發展注入了新的活力，同時對學校教育改革提出了迫切的要求。
1999年，在學校創建世界一流大學計畫正式啟動之際，為了更加明確學校教育教學改革的思路和方向，學校成立了本科教育教學發展戰略研究小組，開始新的人才培養模式的研究和探索。在認真總結國內外、尤其是北大長期教育改革經驗和教訓的基礎上，經過反覆論證，學校提出了北大本科教育人才培養的新目標和新模式。
一是作為以世界一流大學為建設目標、負有為民族和國家的強盛培養領軍人物責任的綜合性研究型大學，其人才培養的基本目標是為國家社會主義現代化建設事業培養能夠在各個行業起到引領作用的頂尖專業人才。但這個任務從總體上來說，單靠本科教育是完不成的，只能在包括本科生和研究生在內的完整的大學教育中完成。那么本科教育的任務是什麼呢？就是進行高等教育的基礎教育，培養基礎知識寬厚、創新意識強烈、具有良好自學和動手能力的適應性強的高素質人才，這樣的人才既可以成為研究生教育階段的生源（從這個意義上說本科教育主要就是給研究生教育打基礎），也可以成為社會需要的適應面廣的複合型人才。
二是為實現上述目標，確立本科教育的基礎地位，有必要在低年級實行通識教育，在高年級實行寬口徑的專業教育，同時進行學習制度的全面改革，實行在教學計畫和導師指導下的自由選課學分制。經過兩年的討論和醞釀，上述教育思想逐步確定下來，成為新世紀北大本科教育的基本理念。"元培計畫"就是為了實踐這一教育理念於2001年秋正式開始實施的。
改革實踐
北京大學元培學院實施元培計畫以來，學校按照元培計畫的基本理念，通過點面結合、逐步推進的方式推動全校範圍內的教學內容、教學方法和教材的改革，調整教學計畫；推動公共課程自由選課制；著手研究本科教育和研究生教育的關係與銜接；研究實行學分制後如何更有效地進行學生思想政治和生活管理工作。
（1）從2003年開始，全校大部分院系都實行按院系或者學科大類招生。考生按院系填報志願，按院系錄取。學生被錄取後，進入相應院系，先學習通選課及這個學科的共同基礎課，經過一年、兩年或者三年的基礎課學習後，進行分流，由學生根據自己的興趣自主選擇學習的專業。
（2）2002-2003年全面修訂本科教學計畫，將畢業總學分數由150學分壓縮到140學分以內，將必修課學分數壓縮到總學分的60%以內，取消限制性選修課，增加學生自由選課和選擇專業的空間；增加16個通識教育通選課學分的要求，實踐通識教育的理念。
（3）建設320門本科生素質教育通選課，為低年級普遍實行通識教育準備師資和課程。
（4）全校公共課打破過去按專業班級統一排課的固定模式，在大力改革教學內容的同時，實行新的學習制度：在保證必修課性質不變的前提下，由學生根據自己的不同情況選擇學習的時間和課堂；有關院系在教學計畫指導下，根據學生選課的情況開課。公共政治理論課、思想品德課、體育課、文科計算機課、大學英語課先後開始，逐步推行，全校公共必修課大部分都實現了自由選擇上課時間和課堂。
（5）對本科生全面實行導師制。
辦學模式
北京大學元培學院元培計畫實驗班按照新的教育理念，按照新的模式進行培養，即在低年級實行通識教育和大學基礎教育，在高年級實行寬口徑的專業教育，在學習制度上實行在教學計畫和導師指導下的自由選課學分制。概括起來，它在學習和生活上的主要制度安排是：
（1）低年級實施通識教育。學生入學時不分專業，只按文理兩類招生。入學後，主要學習通識教育選修課和學科大類平台課，實施通識教育。
（2）自主選擇課程和專業。學生根據自身特點和興趣在教學計畫和導師指導下自由選擇通識教育課和平台課，在對自身特點、北大的學科狀況、專業設定、培養目標以及其他情況有了進一步了解後，選擇進一步學習的專業領域。一般在第二學期末，他們要提出專業意向申請，第三學期末確定最終的專業方向，之後在有關院系選課，修學各專業教學計畫規定的專業必修課和任意選修課。
北京大學元培學院（3）學分制。學生根據教學計畫和導師指導修滿規定的學分即可畢業。在導師指導下根據自己的情況安排學習進度，在3-6年內完成學業。
（4）導師制。學校從各院系聘請34位資深教授作為導師，對學生進行選課、選專業、學習內容及方法、研究方向等指導。
（5）管理和生活制度上的設計和安排。學生在高年級進入專業後仍保持原有行政班級，統一由元培計畫管理委員會管理，不同專業的學生混合居住，為不同學科學生的相互交流和學習創造條件。
現任領導
黨委領導
黨委書記：吳艷紅
黨委副書記：丁夕友
行政領導
院長：李猛
副院長：劉建波、李泊橋、孫飛宇
社會影響
北京大學元培學院元培計畫實驗班從2001年開始招生。實驗班一經推出，迅速在社會上產生廣泛影響。學生和家長通過切身感受對元培計畫越來越歡迎。2002年以後元培計畫實驗班直接從高考學生中招生。幾年來，歷屆學生的平均錄取成績一年比一年高。2003級140名新生中，有8位文、理科省級高考總分第一名， 6位國家級學科競賽一等獎得主，其中一位獲得國際奧賽金牌。2004年，有10位文、理科省級高考總分第一名考入元培計畫實驗班，成為北京大學當年錄取省級高考總分第一名最多的院系級教學單位；有20名全國學科競賽一等獎獲得者，其中有3名化學國際競賽金牌得主選擇了元培計畫實驗班。2005年實驗班招生156人，其中有17位（文科9位、理科8位）省級高考總分第一名。 2006年實驗班招生178人，其中有12位省級高考總分第一名。
學生風采
《下一站》海報學生作品微電影《下一站》：由元培學院大二學生劇組AGOI創作的校園電影《下一站》於2012年9月21日網路首映，電影一經發布，3天內點擊量突破50萬，收到近1萬條網友評論。電影講述了男主人公從高中到大學的情感經歷，並在元培結識的朋友支持下走出了過去的陰影，勇敢地前行的故事。
