共價調節酶
共價調節酶一般都存在相對無活性和有活性兩種形式，兩種形式之間互變的正、逆向反應由不同的酶催化。磷酸化是可逆共價修飾中最常見的類型。因為信號激酶能作用於很多耙分子，通過磷酸化作用信號能被極大地放大。蛋白激酶的調節作用能被催化水解磷酸基團的蛋白質磷酸酶逆轉。通過磷酸化和脫磷酸化作用，使酶在活性形式和非活性形式之間互變。
如骨骼肌中的糖原磷酸化酶的形式
如骨骼肌中的糖原磷酸化酶有兩種形式：活性較篙形式——磷酸化酶a ，是由四個亞基組成的寡聚酶，每一個亞基含有一個被磷酸化的Ser殘基；活性較低形式——磷酸化酶b，由兩個亞基組成。兩分子的磷酸化酶b在磷酸化酶b激酶的催化下，每個亞基上的Ser14殘基接受ATP提供的磷酸基團，形成四聚體的磷酸化酶a。磷酸化酶a在磷酸化酶磷酸酶的作用下脫去磷酸基又轉變為磷酸化酶b。磷酸化酶的活性形式和非活性形式之間的平衡，使磷酸基共價地結合到酶分子上或從酶分子上脫下，從而調節控制此酶的活性。共價調節酶主要有磷酸化 / 脫磷酸化和腺苷酸化 / 脫腺苷酸化兩種形式，此外還有甲基化 / 脫甲基化，乙醯基化 / 脫乙醯基化等。如E.coli 谷氨醯胺合成酶及一些其它的酶，它們受ATP提供的腺苷醯基的共價修飾或酶促脫腺苷醯基而調節酶活性。
