會議內容
報告
會上蔣介石作黨務報告，譚延闓作政治報告，何應欽作軍事報告，陳果夫作監察工作報告。
理論
反對階級鬥爭理論
會議反對中共的階級鬥爭理論，強調國民黨不分階級，代表全民。
會議通過《黨政決議案》，稱：“過去數年間本黨一切理論法令規章，為共產反動思想所撬雜，以致黨內在思想上失卻統一之意志，在法令上缺乏一貫之系統，在實際行動上減少團結的力量，在國家建設上尚無共信共守的根本大法之原則與標準。 此實黨政上最大的缺點。”
會議說北伐革命對象為軍閥、共產黨與帝國主義，指責蘇聯為“赤色帝國主義”。
措施
結束軍政施行訓政
會議正式宣布軍政時期結束，訓政時期開始。
“確定總理主要遺教——《三民主義》、《五權憲法》、《建國方略》、《建國大綱》及《地方自治開始實行法》為訓政時期中華民國最高根本大法”。
人事任免
開除國民黨二大中執委員、中監委員與候補中執委員、候補中監委員中的中國共產黨人國民黨籍。
開除或停止鄧演達、彭澤如、徐謙、陳其瑗、路友於等人的國民黨籍。
恢復西山派林森、張繼、謝持、鄒魯、居正、石瑛、覃振、石青陽、茅祖權、沈定一的國民黨籍。
開除陳公博、甘乃光的國民黨籍，開除顧孟餘三年黨籍，給汪兆銘以書面警告。
開除李宗仁、白崇禧、李濟深的國民黨籍，會議期間決定討伐桂系。
選出中央執行委員36人：
蔣介石、譚延闓、戴季陶、何應欽、胡漢民、孫科、
閻錫山、陳果夫、陳銘樞、葉楚傖、朱培德、馮玉祥、
吳鐵城、于右任、宋慶齡、宋子文、汪精衛、伍朝樞、
何成浚、李文范、王柏齡、邵元沖、朱家驊、張群、
劉峙、楊樹莊、方振武、趙戴文、周啟剛、陳立夫、
劉紀文、陳肇英、劉廬隱、丁惟汾、曾養甫、方覺慧等。
選出候補中央執行委員24人：
王伯群、丁超五、王正廷、陳耀垣、張貞、趙丕廉、
孔祥熙、劉文島、魯滌平、張道藩、繆斌、經亨頤、
余井塘、薛篤弼、桂崇基、焦易堂、馬超俊、黃實、
陳策、鹿鍾麟、陳濟棠、程天放、苗培成、克興額等。
選出中央監察委員12人：
吳稚暉、張靜江、古應芬、林森、蔡元培、王寵惠、
李煜瀛、邵力子、鄧澤如、蕭佛成、張繼、恩克巴圖等。
選出候補中央監察委員8人：
褚民誼、陳布雷、商震、陳嘉佑、李烈鈞、林雲陔、劉守中、鄧青陽等。
一中全會
1929年3月28日~1929年4月8日，在南京召開三屆一中全會。
推選蔣介石、胡漢民、譚延闓、孫科、戴季陶、于右任、丁惟汾、陳果夫、葉楚傖等九人組成中央執行委員會常務委員會。
推蔣介石為組織部長，葉楚傖為宣傳部長，戴季陶為訓練部長，陳立夫為秘書長，組成中央黨部。
會議通過了《中央執行委員會組織法》，其中規定增設中央統計處。
汪派的陳公博、顧孟余等被開除黨籍，汪亦受到警告，汪派與南京完全破裂。
蔣的親信陳果夫、陳立夫兄弟，一任中央執行委員會常務委員，一任中央黨部秘書長，握黨的實權，人稱CC系。
對於該會人事安排和通過的軍隊編遣方案，閻錫山、馮玉祥也極為不滿，最終導致中原大戰。
會議影響
1929 年 3 月，中國國民黨第三次全國代表大會在蔣中正主導之下召開，80%的代表都是被指派；而改組派和西山會議派當中，除了汪精衛和鄧澤如以外，沒有一個人當選，自然引起了兩派的不滿。改組派和西山會議派紛紛質疑第三次全國代表大會的合法性。
第三次全國代表大會召開後，汪精衛在會中嚴辭攻詆蔣中正的專權，並且質疑會議的合法性，結果改組派多數人因此被開除黨籍，汪精衛也被書面警告。在這樣情況下，改組派於是以“護黨救國”為“反蔣”的口號，並策動上述軍閥在軍事上反蔣。
改組派與西山會議派質疑第三次全國代表大會的合法性，所以便主張應該重開第三次全國代表大會；而第三次全國代表大會應該以“第二次全國代表大會代表”選出的中央執行委員為代表，行使職權。
由於 1925~1926 年國民黨容共期間，國民黨因為內部分裂，造成滬粵分立，而第二次全國代表大會在上海和廣州兩地各自舉行，各自選出自己的中央執行委員。當時上海的國民黨為國民黨右派，即西山會議派，廣州的國民黨為國民黨左派，即後來改組派大部份的成員，而 1930 年反蔣軍人的“中央執委會委員”資格多半取得於蔣中正主導的“第三次全國代表大會”。
1930 年 3 月，閻錫山以為了集結“反蔣”的力量邀集西山會議派與改組派開會，建議由中國國民黨第一、第二、第三次全國代表大會的所有中執委共同組織”擴大會議“，以調合各派的主張。
1930年7月13日，中原大戰爆發後，“殘餘軍閥”、改組派與西山會議派各方均妥協同意召開“擴大會議”，並且發表宣言，強調國民黨的民主、法治，指責蔣中正“背叛黨義，篡奪政權”，「託名訓政，以行獨裁專制，剝奪人民公私權利」等。
1930年8月7日，中原大戰進行當中，“擴大會議”在北平正式召開，並且成立國民政府。
1930年9月1日，“擴大會議”中推舉閻錫山為國民政府主席，9 日就職。
後來因為閻錫山兵敗，所以不到十天北京國民政府即告結束，國民政府再轉移至太原。汪精衛為了標榜國民黨的民主、法治精神，以別於蔣中正的“獨裁”，所以在1930年12月 27 日公布了「訓政時期約法草案」，史稱「太原約法」，一時之間，頗得輿論的好評。
