結構和功能
綠裸藻綠色裸藻為高度分化的單細胞體。身體呈紡錘形，長約90微米，前端寬而鈍圓，後端尖而窄，橫斷面呈圓形稍扁。體表具有一層螺鏇紋的彈性表膜，能使身體具有經常不變的形狀，但有時也能緩緩地收縮和伸展，在遊動時作扭曲的變形。如用光學顯微鏡觀察，可將甘油引入蓋玻片下，表膜即可清楚地顯現出來。通過電顯微鏡研究，表膜分為三部分質膜或稱三分質膜。
綠眼蟲藻前端中央為胞口，一般認為已無吞食作用。胞口下連凹陷深入體內的管狀胞咽，下方為擴張的貯蓄泡。胞咽旁有一個淺杯狀的紅色眼點，它由類胡蘿蔔素的小顆料埋在無色基質中而組成。眼點旁有一個光感受器，它有感光性並能調節向光運動。眼點是原始的感光器官，如被破壞，立即失去對光的反應。
在貯蓄泡附近的細胞質內，有許多不甚明顯的小泡（收集泡），可癒合成一個大的伸縮胞，一般滲入體內的多餘水分便經伸縮泡的收縮而壓入貯蓄泡內，再經胞咽、胞口排出體外，藉以平衡滲透壓和排泄部分代謝廢物（排泄作用主要是在體表進行）。伸縮泡能作周期性的收縮。
由胞口處伸出一條細長且有彈性的鞭毛，是它的運動細胞器。在電子顯微鏡下觀察，它是由細胞膜內圍繞著縱行排列的微管系統構成的。一般認為鞭毛的彎曲與微管的收縮有關。鞭毛的基部有分叉的軸絲伸達貯蓄泡低。在分叉處有基粒，每一條軸絲在貯蓄泡低和一個生毛體相連，由它生出鞭毛。從一個生毛體又生一條細絲稱為根絲體，穿過貯蓄泡與核外中心體相連，因此有人認為鞭毛是受核控制的。鞭毛、基粒、軸絲和生毛體合稱鞭毛器。由鞭毛不停地擺動或鏇轉，使綠色裸藻沿自身中軸向前鏇轉運動。用弱碘液染色即可看清鞭毛。
在綠色裸藻體後部，有一個較大的圓形細胞核，核質稀疏，中間為易染色的核內體。可用醋酸洋紅染色觀察。
細胞質中有許多放射狀排列的載色體。呈綠色長形和橢圓形。載色體內有含有大量葉綠素a、b、β-胡蘿蔔素和葉黃素，進行光合作用製造有機物。貯存養分以副澱粉為主，另外少量油質。副澱粉由d-葡萄糖高聚合而成，它與一般澱粉不同，遇碘不呈藍紫色，又叫裸藻澱粉。在無光條件下，綠色裸藻可通過體表進行呼吸和吸收養料而生活。例如在裝有綠色裸藻的杯內，滴入少許馬鈴薯汁，置暗處，數日裸藻失去綠色但並未死亡。再移置光下，過些日子又可變綠，重新恢復光合作用。
縱二分裂的無性繁殖
縱二分裂繁殖過程模式圖綠色裸藻用無性的縱二分裂進行繁殖。在細胞分裂時，核膜、核仁並不消失，而是一分為二。分裂間期染色體仍是一條條的，不形成均勻的染色質。當鞭毛脫落後，生毛體複製為二，隨即原生質從前端沿中線向後端開裂，同時由生毛體長出二條新的鞭毛（有的是一個子細胞保留原來的鞭毛，另一個子細胞長出新的鞭毛）。胞口和載色體也縱裂為二，最後斷裂為二個新個體。新個體較小，在水域中繼續生長變大。
不可低估胞囊的作用
在胞囊內進行縱二分裂綠色裸藻之所以生命力強、分布廣泛、是與它能形成胞囊分不開的。
在池水乾涸等怎條件不利時，裸藻的身體先失去鞭毛並變圓、靜止不動。由原生質分泌出一種膠狀物質，凝固後把自身包圍起來形成胞囊，以度過不利時期。胞囊很輕，可以隨風飄泊，遇到適宜環境，它則在囊中進行多次縱二分裂，然後破囊而出，成為多個新個體。
