操作方法
l.樣品DNA的限制性內切酶消化
(1)取2μg樣品DNA溶液加入0.5ml的EPPENDORF管中,加2μl10×限制性內切酶緩衝液,6~10個U的相應限制性內切酶,加消毒雙蒸水至總體積20μl,於37℃保溫酶解2小時,按上述條件用適當的幾種不同的內切酶進行單酶或雙酶解。
(2)在65℃加熱5分鐘或用適量的0.5mol/LEDTANa2終止反應。
2.DNA酶解片段的電泳分離
取DNA酶解作品2μl加上樣緩衝液10μl(含溴酚藍指示劑和甘油),在0.8%瓊脂糖(含0.5μg/ml溴化乙錠)凝膠進行水平電泳,電壓<5V/cm,時間2小時左右,用紫外燈觀察分析。
注意事項
1.分子克隆是微量操作技術,DNA樣品與限制性內切酶的用量都極少,必須嚴格注意吸樣量的準確性及全部放入反應體系中。
2.要注意酶切時加樣的次序,一般次序為水、緩衝液、DNA各項試劑,最後才加酶液。取液時,Tip頭要從溶液表面吸取,以防止Tip頭沾去過多的液體與酶,待用的內切酶要放在冰浴內,用後蓋緊蓋子,立即放回-20℃冰櫃,防止限制性內切酶的失活。
3.凡用在酶切反應中的一切塑膠器皿(Eppendorf管,Tip頭等),都要新的,最後用重蒸水清洗,濕熱滅菌,置50℃溫箱中烘乾,使用前打開包裝,用鑷子夾取,不直接用手去拿,嚴防手上雜酶污染。
4.當樣品在37℃與65℃保溫時,要注意:
(l)防止因蓋子未蓋嚴密使水汽進入管內,使反應溶液體積大量增加,造成實驗失敗。
(2)防止由於標籤脫落,分不清樣品類型。
5.由於溫差原因,往往在蓋上有水汽,因此樣品酶切完畢或中間取樣電泳要離心2秒鐘,以集中體積內溶液,否則會發現酶切後體積少了。
試劑器材
1.試劑
(1)限制性內切酶:如EcoRI、HindⅢ、PstⅡ、BamH1等,-20℃貯存。
(2)樣品DNA:如λDNA、pBR322等,-20℃貯存。
(3)限制性內切酶緩衝浪配製,見下表(用消毒雙蒸水配製,貯存於-20。C);
(4)10×tbe電泳緩衝液:0.89mol/LTris;0.89mol/L硼酸;0.02mol/LEDTANa2pH8.0,高溫滅菌,貯存於4℃。(5)6×上樣緩衝液:0.25%溴酚藍;40%蔗糖;用消毒雙蒸水配製,貯存於4℃。
(6)溴化乙錠溶液:稱取溴化乙錠5mg溶解於lml消毒雙蒸水中,4℃避光保存。
(7)消毒雙蒸水。
2.器材
恆溫水溫箱;電泳儀;水平電泳糟;50μl可調移液器;紫外燈