免疫球蛋白分子可變區的胺基酸序列主要在三個區域存在很大的變異性,這些區域被稱為高變區(hypervariable region),分別定位HV1,HV2,HV3,其中HV3變化最大。由於免疫球蛋白分子用這些高變環以表面互補的方式結合抗原,因此這些高變區又叫做互補決定區(complementarity-determining region,CDR),不同重鏈輕鏈的CDR組合決定了抗體對抗原的特異性。在高變區之間的區域胺基酸序列的變化則較小,稱為骨架區,輕鏈和重鏈各有四個骨架區。
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