非同源性末端接合

非同源性末端接合(Non-homologous end joining, NHEJ) NHEJ修復機制完全不需要任何模版的幫助，此一機制的修復蛋白可以直接將雙股裂斷的末端彼此拉近，再藉由DNA連線酶(ligase)的幫助下，將斷裂的兩股重新接合。

相較於HR，NHEJ的機制既簡單又不依靠模版的方式，在基因體越複雜、包含越多無用DNA(junk DNA)的生物體，NHEJ的活性相對於HR是非常活躍的，可是在基因體越簡單，尤其是單細胞型態的生物，NHEJ很有可能破壞原本序列完整性，反而不受青睞。

非同源性末端接合

在姐妹染色單體上的核苷酸序列未能有效引導修復系統正確連線斷裂的雙鏈末端的情況下，NHEJ就發揮作用修復DNA雙螺旋。在NEHJ過程中，對來自兩個雙鏈端單鏈的切割形成ssDNA，這些ssDNA可相互連線，可能是通過鹼基間的有限配對實現的。接著填補單鏈缺口，連線其他剩餘的ssDNA，重建DNA螺旋上最初出現的缺乏鹼基的雙螺旋結構 。