歷史沿革
抗日戰爭前，轄區為金蓋鄉，民國30年(1941)為雲巢鄉，解放後，仍設雲巢鄉。此後，曾劃為雲巢、山塘兩鄉，旋又合併。1958年10月，與妙西鄉合併建雲巢公社，1961年6月，雲巢公社調整為雲巢、妙西、南埠3個公社。1965年8月，雲巢公社建制撤銷，分別劃歸菁山等公社，1984年4月，菁山公社劃出部分新建雲巢鄉。以境內有雲巢山而得名。
雲巢鄉經濟發展
近幾年來，農業開發力度加快，雲巢鄉積極鼓勵引導農民加大農業開發力度，發展效益農業。
1992年9月，全鄉程控電話開通。
1997年7月，開始有線電視的轉播。
1998年，全鄉青梅、早園竹、國外鬆開發麵積比上一年增長187%，達到了800畝。以青蝦、河蟹、龜鱉為主的特種水產養殖比上一年增長55%，達到了400畝，全鄉出現了一股爭著上山搞開發、下水搞養殖的熱潮。個私經濟發展迅速，近幾年來，以經編針織、絲綢業為主的個私經濟發展迅猛。據統計，1998年全鄉已擁有經機215台、絲織機1050台，1998年銷售收入突破1億元。
1998年8月，投資225萬元的鄉中心國小竣工交付使用。
雲巢鄉除交通便捷等硬體投資環境外，積極創造優越的軟體環境，來引進資金、人才、技術，開拓發展經濟。凡外地人員到雲巢投資開發的，在租用土地、用電、用水等方面給予優惠，在辦理手續上給予簡化，積極為他們創造一個更好的外部環境。1998年，從北京引進資金70萬元創建了一個百畝特種水產養殖場；從杭州引進人才技術，租用50畝創辦了一個百萬珍禽養殖場；還有奉化花木專業戶也特意來到了“下菰城遺址”附近，投資20多萬元創辦了花卉、苗木、藥材基地。
一方特產雲巢鄉
一方特產——菰城旗槍。雲巢鄉下菰城處所產茶葉名為“菰城旗槍”，在清明前後採集茶樹的嫩芽通過專業的炒茶師手工炒作而成，做工非常講究，沏成茶後，色澤翠綠、香氣濃郁、味甘醇、形挺秀，是色香味形兼備的一方名茶。
一方名村
一方名村——雲巢村。村以雲巢山得名，礦產資源豐富。1984年自己籌集資金5萬元，向銀行貸款17萬元，開辦百鳳山石礦，生產各種規格建築石料，產品銷往上海，當年就獲利7萬元。1985年與省疏浚工程處聯營梅山石礦，當年創產值54萬元，獲利8.2萬元。1988年與上海住宅公司採用補償貿易形式合作興辦金山塢石礦。目前三隻石礦生產都得到了擴大，利稅數額可觀。近幾年來，雲巢村把礦上所得利潤用於公益事業的建設，得到了全村人民的一致好評。
一方名勝
一方名勝——金蓋山。鄉境內有金蓋山，海拔292米，山勢迴旋，猶如華蓋，山頂常有雲氣繚繞，如煙如霧，故又名雲巢山，“金蓋出雲”是吳興八景之一。山上翠竹茂密，樹木蒼勁，細水潺潺，《金蓋山志》載有呂潭、甘泉等28個景點。山塢中有古梅花觀，其開山祖師是南朝陸修靜。古梅花觀又名純陽宮，是一個建築群。大殿供道教全真派呂純陽祖師像，有崇德堂、中天寶閣、撥雲精舍、古奇假龕、金峰師堂、古書隱樓等建築106間，是浙江省最大的一座道觀。山頂有電視轉播塔，與道場山上的多寶塔遙遙相對。山麓有下菰城，公元前248年，楚國春申君封於江東，築下菰城，現為省級重點文物保護單位。古梅花觀旁建有古梅山莊，供旅遊觀光者飲食、住宿、休閒、娛樂。金蓋山有“小莫乾山”之稱。雲巢鄉也就成為湖州市南郊風景區的重要旅遊勝地。
