歷史與現狀
解放前，基督教各教派在昆明都開辦了神學院校，規模較大的有內地會開設的"車家璧聖經學校"、神召會開辦的"靈光聖經學校"等。1950年，佴家灣78號靈光聖經學校房產作為神學院宗教房產進行了登記，在昆各基督教院校合併辦學，改名"昆明靈光聖經學院"。“昆明靈光聖經學院”占地24.461畝，建築面積792平方米。“文革”期間，佴家灣78號教產由昆明市房管局託管。
為了緩解雲南基督教教牧人員青黃不接的狀況，培養愛國愛教的教牧人員，在省委、省政府的大力支持和海外基督教友好團體的幫助下，雲南省基督教“兩會”在昆沙路59號購得一占地2畝，建築面積1722平方米的房產。1989年3月，經雲南省人民政府批准，雲南基督教神學院由雲南省基督教“兩會”開辦。
2007年1月，因昆明市政府實施昆沙路拓寬改造工程，神學院房舍被拆除。之後曾先後租用筇王路民房、呈貢基督教恩光堂繼續辦學，在艱難的環境中繼續堅守崗位，積極開展神學教育工作，為教會輸送了一批年輕教牧人員。
新建雲南基督教神學院選址位於昆明市五華區普吉辦事處大普吉村，建設用地面積為15228平方米，項目規模
按在校學生200人進行設計，建設內容包括禮拜堂、教室、圖書館、辦公用房、師生宿舍、後勤用房等，建築總面積為9284m²，總投資為人民幣4,096.31萬元。新校舍於2014年末投入使用，教學與學習生活環境得到了很大的改善。
雲南基督教神學院在谷懷空牧師、李從明牧師兩任院長的精心管理下，奠定了良好的發展基礎。自2007年始，由雲南省基督教協會副會長羅德順牧師代院長之職。
自開辦至2016年7月止，本院已畢業17屆，計683名神學生。此外，雲南基督教神學院還承擔了教牧義工的培訓工作，自成立以來已成功舉辦9期教牧義工培訓，受訓人員380人。這些學生存著歡喜、感恩的心回到雲南各基層教會後，在父 神的眷顧、帶領和眾弟兄姊妹的代禱中，他們堅持在雲南教會牧養信徒、管理教會、宣揚真道的侍奉崗位上，正在努力盡“基督之僕人”的職責。
雲南教會自改革開放以來近40年的發展中，信徒人數已增至80萬人，教堂、聚會點3000餘所，有牧師216人，長老、傳道員2000餘人。但教牧人員“青黃不接”仍是制約教會健康發展的主要問題，為雲南教會培養更多合乎主用的傳道人仍是當前本院的首要任務。
目前，雲南基督教神學院現有23名教職員工，其中專職教師13人，管理員10人。有在校學生208名，女生占學生總數的30%，少數民族學生占學生總數的90%，為全國21所基督教院校中最為特殊的神學院校。
培養宗旨
（ 1）為立志投身雲南教會侍奉的弟兄姊妹提供靈性、知識、技巧的全面裝備。
（2）課程設定：新約概論、舊約概論、約翰福音專卷、摩西五經、希伯來民族史、基督教史、聖樂、宣道法、以賽亞書、耶利米書、使徒行傳、羅馬書、啟示錄、哥林多前後書、智慧文學、系統神學、教牧學、釋經學、基督教思想史、基督教倫理學、基督教愛國主義教育、大學語文、中國近代史、特色理論、英語、計算機基礎知識、政策法規等。
學制與招生
（1）本院為三年制神學大專院校，每年招收一班，每年1-4月報名，5-6月考試，9月入學；招生對象是已經受洗加入教會，清楚重生得救，有蒙召經歷，品德良好，愛國愛教，有奉獻心志的弟兄姊妹；具有高中學歷；年齡18-45歲。
（2）招收教牧培訓班，或教牧學大專函授班；招生對象須有蒙召經歷，品德良好，愛國愛教，在教會侍奉3年以上；具有國中以上學歷；年齡25-60歲。
學院地址
雲南省昆明市五華區大普吉小屯路3號（西北部客運站旁）
可乘坐公車1路，189路，151路
