植物體類型多樣:單細胞或分枝絲狀體,能運動或不能運動。產生的動孢子,多具 2 條 不等長或等長的鞭毛,還有少數類群無鞭毛,但能伸出偽足作變形蟲樣運動。細胞裸出或具以果膠質為基質的矽質鱗片,或具囊殼 。金藻為能運動的單細胞種類,其繁殖方法為細胞縱分裂以形成2個子體細胞;群體的種類除細胞縱分裂外,也常斷裂成2個或更多的新群體。此門藻類最獨特的無性生殖方式為在原生質形成的靜孢子,多呈球形,有時為橢圓形。孢子萌發時,其原生質形成一個新個體。有性生殖尚未發現。
金藻門約200屬,1000多種。中國約有 30種。多分布於清潔的貧營養型淡水中,也有的生於半鹹水或海水中,通常在冬、春和晚秋季節生長旺盛。一些種類常作為貧營養型水體的指示生物,如魚鱗藻、錐囊藻等。
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