概念
轉錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內所有轉錄產物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉運RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。
對象
轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進行親和純化的RNA聚合酶II轉錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。
優勢
相對於傳統的晶片雜交平台，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的數位化信號，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍，是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
區別
轉錄組測序與基因表達譜的區別
轉錄組測序技術是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等用高通量測序技術把它們的序列測出來。全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本。反映出它們的表達水平。 基因表達譜指通過構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度信息，這樣編製成的數據表就稱為基因表達譜。
