歷史沿革
1952年，贛州市花卉研究所建所，與贛州市甘蔗研究所，江西省甘蔗研究所三塊牌子，一套人馬合署辦公 。1955年4月，贛州市農業科學研究所建所 。1959年，贛州市林業科學研究所建所 。1963年8月，贛州市畜牧研究所建所 。1973年，贛州市水產研究所建所 。1976年，贛南樹木園成立 。
贛南科學院1978 年，贛州市農機化研究所建所 。1981年，贛州市柑桔科學研究所建所 。1983年，贛州市科技情報所建所，2000年，成立了贛州市生產力促進中心，與贛州市科技情報研究所兩塊牌子，一套人馬，合署辦公 。1996年12月，贛州市菸草科學研究所建所，2009年增掛贛州市旱作物科學研究所 。
2005年7月26日，贛南科學院掛牌成立，以圖改變贛州市科研機構管理體制落後、資源配置浪費、科研任務不足，科研成果不多，與贛州市經濟社會發展的要求嚴重不適應的局面。
2005年4月和2007年11月，贛州市政府分兩步將原隸屬於市農業局、市林業局、市果業局、市科技局、贛州開發區等單位的市屬10家科研單位劃歸贛南科學院管理，歷時兩年的時間完成了機構的劃轉組建工作 。
科研條件
人員編制
截至2018年2月，科學院擁有編制數量1101個，職工總數1230人，其中在職人員636人（在編在崗人員249人，待崗人員357人），退休職工594人；博士2人、碩士研究生64人；在職正高專業技術人員13人、副高專業技術人員44人、中級專業技術人員93人、初級專業技術人員124人。
職工中有享受國務院特殊津貼專家3人，省政府特殊津貼專家3人，市政府特殊津貼專家4人，省百千萬人才工程人選5人，獲市青年科技獎9人，西部訪問學者1人。科研人員274人（含待崗人員）占比43.1%，中級以下職稱人員217人占79.2%，副高以上職稱人員占20.8% 。
科研平台
截至2018年2月，科學院下轄贛州市農業科學研究所、贛州市林業科學研究所、贛州市畜牧研究所、贛州市柑桔科學研究所、贛州市菸草科學研究所（市旱作物科學研究所）、贛州市科技情報研究所、贛州市水產研究所、贛州市花卉研究所、贛南樹木園、贛州市農機化研究所、贛州市稀土研究所和贛州市鎢業研究所、科技發展中心、中心實驗室等14個直屬單位。
贛南科學院建有博士後科研工作站、江西省油茶產業綜合開發工程研究中心、江西省科學院贛南分院、江西省林業科學院贛州分院、中科院植物聯盟（贛南樹木園）、“華中農業大學贛南柑橘農科教合作人才培訓基地”、水稻、臍橙、花生三個國家現代農業產業技術體系綜合試驗站、國家油茶科學中心贛南試驗站、國家（贛州）油茶良種繁育基地、贛州市林木良種繁育中心，蔬菜、水禽、生豬、水產四個省現代農業產業技術體系綜合試驗站 。
2017年8月19日，“中國稀金谷”科技創新平台—“中國（贛州）稀金新材料研究院”掛牌 。
硬體設施
贛南科學院截至2018年2月，科學院共有山林地21627.5畝，土地2081.301畝，科研基地14443.51畝（含試驗田、山林、水域）。2017年，國家水產原良種場建設項目《江西省贛州市斑點叉尾鮰良種場建設》通過正式驗收。
贛南樹木園景區1500米環湖木塑棧道建設全線接通並開放使用，由中國建築設計院承擔的贛南樹木園景區總體規劃設計及2000畝研學旅行基地修建性詳細規劃設計完成總體規劃初步成果編制並通過評審 。
學術交流
2017年，贛南科學院承辦了中科院“贛南蘇區院士行”活動，邀請60多位院士和國內頂級專家來贛州開展相關活動；承辦了江西省農業科技創新聯盟2016年度工作會、江西水禽產業體系2017年度工作會和華中農業大學科學傳播研修講座。
贛南科學院邀請中科院謝華安、謝聯輝院士一行在贛州市開展“發展高效生態農業，實現中央蘇區精準脫貧”調研活動；邀請中國工程院院士、國家柑橘產業體系首席專家、華中農業大學校長鄧秀新等柑橘專家到深入贛州各柑橘主產區調研指導柑橘黃龍病防控有關情況。
贛南科學院協辦國家農業科技創新聯盟在贛州市舉行的柑桔優勢區域黃龍病綜合防控協同創新聯盟成立暨現場觀摩交流會；邀請省科學院、省林科院、江西農大、江西理工、福建農林大學等院校的專家學者到院開展科技交流與合作 。
建設成就
科研成果
崇義縣上堡梯田景區“八卦圖”2017年，贛南科學院實施科研項目213項，在研項目經費累計5137.54萬元，其中，國家級項目11項、省（部）級55項、市（廳）級147項、自選儲備29項。
新增科研項目60項，新增到賬資金1473.02萬元；項目結題驗收13項；申報各級科技獎9項，獲得科技成果獎勵5項，其中，獲省農牧漁業改進獎2項，獲贛州市科技進步獎3項：市柑桔所《贛南臍橙園薊馬防治與推廣套用》、市畜牧所《全小麥飼用改良劑及其豬飼料配方的創製與套用》、贛南樹木園“宛田紅花油茶引種技術研究”獲贛州市科技進步獎。
贛南科學院全年共發表論文65篇；獲得專利5個 。
社會服務
2017年，贛南科學院組織開展了科技宣傳、科技服務90餘次，開展科技諮詢3700人次，培訓2600人次，服務龍頭企業、合作社、種植大戶總計170多家，服務面積達3.9萬多畝。
贛南科學院派出一批農村科技工作經驗豐富的臍橙、油茶、蔬菜、畜牧、水稻等領域專家參加全市農業科技下鄉活動，接受農民民眾科技諮詢100餘次、發放科技資料5000餘份。派出5名縣處級領導幹部赴尋烏縣掛點駐村開展精準扶貧工作。派出中、高級職稱科技專家78人參與活動，為推動科技特派員工程取得實效，策劃實施了“科技特派員在行動”活動，活動涵蓋了臍橙、油茶、蔬菜、生豬、家禽、水稻、水產和花卉苗木等贛南特色優勢產業，覆蓋了全市17個縣、市、區。
2017年5月，舉辦了“贛南科學院2017年科技活動周活動”活動，組織了臍橙、油茶、生豬、蔬菜、水產等產業科技專家深入各產業縣開展科技諮詢和科技服務，贈送科普書籍2000餘冊、發放《科普宣傳手冊》等技術資料3000餘份 。
人才培養
博士後科研工作站揭牌2015年11月，贛南科學院獲人力資源社會保障部、全國博士後管理委員會批准博士後科研工作站。
2017年7月25日，贛南科學院舉行贛南科學院博士後科研工作站博士後進站暨揭牌儀式，贛南科學院博士後科研工作站正式運行，華中農業大學園藝林學學院王璞博士成為第一位進入該站的博士。
首位進入該站的華中農業大學茶學專業王璞博士對江西野生茶樹的收集與利用進行課題研究 。
文化傳統
院徽贛南科學院院徽由雙圓構成，外圓由贛南科學院中英文名組成。
內圓以北半球為背景，象徵著贛南科學院“科技立院、人才強院、產業興院、開放辦院”的辦院方針。
北半球之上為贛南科學院英文簡稱。
現任領導
黨委書記：江樹華
院長、院黨委副書記：溫揚漢
副院長、黨委委員：劉義生
副院長、黨委委員：吳海洋
副院長、黨委委員：朱恩華
黨委委員：郭小華
