歷史沿革
西藏藏醫學院前身系西藏藏醫學校（中專）和西藏大學藏醫系。
1989年9月，成立西藏大學藏醫學院。
1993年2月，國家教委教批准獨立設定藥王山藏醫學院；編寫了全國第一部《藏醫專業本科教學大綱》。
1996年，學院先後成立了西藏藏醫學院教學藥廠和西藏藏醫學院教學門診部。
1999年，被批准為民族醫學（藏醫）碩士學位授予點。
2001年，國家教育部批准更名為西藏藏醫學院。
2002年，承擔國家中醫藥管理局組織的11本《21世紀藏醫專業本科規劃教材》編寫工作，按預定計畫完成並投入教學使用。
2004年，開始與北京中醫藥大學聯合招收培養世界上首批民族醫學（藏醫專業）博士研究生；西藏藏醫學院藏藥廠（教學藥廠）順利通過國家GMP認證。
2006年，學院順利通過國家教育部普通高等學校本科教學工作水平評估，評估結論為合格；該院成功舉辦了全區藏醫藥學術研討會。
2007年7月，該院與北京中醫藥大學聯合培養的首屆兩名藏醫博士研究生畢業。
2011年1月5日，與哈爾濱醫科大學簽署對口支援協定，正式確定由哈爾濱醫科大學對口支援西藏藏醫學院。
2014年，經國務院學位委員會批准，該校新增臨床醫學碩士專業學位授權點。
2018年12月10日，西藏藏醫藥大學新校區開工
2018年12月28日，西藏藏醫學院更名為西藏藏醫藥大學揭牌儀式在拉薩舉行。
學校風景辦學條件
師資力量
西藏藏醫學院據2016年1月學校官網信息顯示，學院有教職員工190人，其中專任教師90人。具有高級職稱的31人，博士生 導師3人，博士生指導小組成員10人，碩士生導師26人，享受國務院特殊津貼專家2人，全國藏醫藥醫師資格考試命題首席專家1人，國家和自治區藥品評審專家5人，國家非物質文化保護遺產傳承人5人，自治區級教學團隊1個。
全國藏醫藥醫師資格考試命題首席專家：尼瑪次仁
享受國務院特殊津貼專家：尼瑪次仁、格桑頓珠
自治區級教學團隊：藏醫臨床學科組教學團隊（帶頭人：索朗平措，2009年獲評）
院系概況
據2018年11月學校官網信息顯示，學校設有5個教學機構，開辦有5個本科專業，4個專科專業，教育部新批准護理學、市場行銷2個本科專業。
教學機構：藏醫系、藏藥系、繼續教育部、研究生處、基礎部
本科專業：藏醫學、藏藥學、藏醫學（護理學）、藏醫學（臨床藥學）、藏藥學（市場行銷）
專科專業：藏醫學、藏藥學、藏醫學（護理學）、天文星算
教育部新批准本科專業：護理學、市場行銷
教學建設
校容校貌據2016年1月學校官網信息顯示，學校先後編寫了全國第一套共24本“21世紀藏醫專業本科規劃教材”的11本，全國第一部《藏醫專業本科教學大綱》， 全國第一套共10本的“21世紀藏藥專業本科規劃教材”等；擁有國家特色專業建設點2個；擁有自治區級精品課程7門，校級精品課程16門；國家人才培養模式創新實驗區1個，國家教育體制改革試點項目1個。
國家特色專業建設點：藏醫學、藏藥學
國家人才培養模式創新實驗區：構建傳統與現代相結合的藏醫藥現代高等教育體系與人才培養模式實驗區
國家教育體制改革試點項目：藏醫藥
自治區級精品課程：藏醫人體學、藏醫內科學、藏醫外治學、藏醫外傷學、藏藥植物學、藏醫藥理學、天文星算學
校級精品課程：藏醫人體學、藏藥植物學、藏醫外治學、藏醫診斷學、藏醫三大基因學、藏醫內科學、藏醫外傷學、藏藥藥理學、藏藥水銀洗鍊法、大學語文、大學英語、思想道德修養、藏文語法、藏醫臨床技能學、天文歷算學、藏醫保健學
學科建設
據2016年1月學校官網信息顯示，學校1999年被批准為民族醫學（藏醫）碩士學位授予點，2004年開始與北京中醫藥大學聯合招收培養世界上首批民族醫學（藏醫專業）博士研究生；開設有1個二級學科碩士學位點，1個專業碩士學位點，2個自治區重點學科建設項目，3個國家中醫藥管理局重點學科。
二級學科碩士學位點：民族醫學（藏醫專業）
專業碩士學位點：臨床醫學碩士
自治區重點學科建設項目：藏醫學、藏醫基礎理論
國家中醫藥管理局重點學科：預防保健學、藏藥方劑學、藏藥藥理學
合作交流
•對外交流
學校風景據2016年1月學校官網信息顯示，學校先後多次派遣專家赴美國、英國、南非、巴西、日本等24個國家訪問講學；先後為30多個國家和地區的學者講授藏醫藥學，並於1994年在英國開辦藏醫班。
•教育受援
2002年，根據教育部辦公廳教民廳函字〔2002〕7號檔案精神，教育部確定北京中醫藥大學、成都中醫藥大學、上海中醫藥大學、廣州中醫藥大學、天津大學、南京藥科大學和高等教育出版社作為該校的對口援助單位。該校分別與上述6所高校和教育部高等教育出版社簽訂了《援助協定書》，確定了具體的援助項目。2007年，根據全國教育部教育援藏工作會議精神，該校新確定的對口援助高校為北京中醫藥大學和江西中醫藥大學。2007年4月該校與這兩所高校洽談援助項目，並簽訂了《援助項目協定書》。
學術研究
科研平台
據2016年1月學校官網信息顯示，學校有省部級以上科研平台4個，其中省部共建重點實驗室2個。此外學校還建有中央與地方共建高校特色優勢學科實驗室建設項目4個以及藏醫藥研究所。
中央與地方共建高校特色優勢學科實驗室建設項目：藏藥新藥實驗室、藏醫臨床實驗室、藏藥種植實驗室、傳統藏藥炮製工藝實驗室
省部共建重點實驗室：藏醫藥重點實驗室（與教育部共建）、藏醫藥與高原生物重點實驗室（與科技部共建）
建設成果
據2016年1月學校官網信息顯示，學校編著出版了300萬字的藏醫藥學巨著《四部醫典大詳解》。承擔了國家科技部863計畫藏醫藥研究技術平台項目、科技部973計畫項目4項、國家自然科學基金項目5項、國家科技支撐計畫項目4項。
2000年，該院《四部醫典大詳解》獲得國際藏醫藥學術會金獎。
2005年，該院《四部醫典大詳解》獲得國家科技進步二等獎。
2012年，該校科研技術“喜瑪拉雅紫茉莉的育種與大田種植方法”獲得國家知識產權局發明專利證書。
2015年，由該校教務處處長次仁副教授申報的國家自然科學基金--地區科學基金項目《藏藥典方降糖解毒湯劑治療糖尿病的物質基礎研究》（項目批准號：81560710）獲得國家自然基金委資助，項目資金：43.2萬元。
2015年，該校學工處邊巴次仁處長主持的國家教育部人文社會科學研究---規劃基金類項目《藏醫藥文化傳承與發展研究》（項目批准號：09YJA840033）正式通過國家教育部結題驗收。
| 項目名稱 | 立項時間 | 項目來源 |
| 206、209B肝藥“火炬計畫項目” | 1998年6月 | 國家科技部 |
| 國家高技術研究發展計畫“863”項目《藏醫藥技術研究平台》 | 2004年10月 | 國家科技部 |
| 國家973項目---重要常見病病發機理與防治新方法研究 | 2005年8月 | 國家科技部 |
| 國家973項目----高原紅細胞增多症的發病機理及預防方法的研究 | 2008年3月 | 國家科技部 |
| 區域民族特色藥物研究與開發“十一五”支撐項目子項目---滋補酥油丸新劑型改造 | 2006年10月 | 國家科技部 |
| 瀕危藏藥材種植研究 | 2006年8月 | 國家教育部 |
| 藏藥多血康對高原多血症紅細胞及EPO及HIF基因表達的影響 | 2007年8月 | 國家自然基金 |
| “十一五”國家科技支撐重點項目“民族醫藥發展關鍵技術示範研究”子課題：藏藥佐太特色炮製工藝及其安全性評價 | 2008年11月 | 國家科技部 |
| 21世紀藏藥本科教材教學大綱 | 2009年6月 | 教育部 |
| 傳統藏藥炮製工藝規範化研究 | 2009年6月 | 教育部 |
| 二十一世紀藏醫專業本科教材 | 2001年3月 | 國家中醫藥管理局 |
| 藏醫藥本科教學內容和課程改革研究 | 2012年4月 | 西藏自治區教育廳 |
| 《藏醫精要飾花集》 | 2004年6月 | 國家中醫藥管理局 |
| 《名醫精粹選集》 | 2004年6月 | 國家中醫藥管理局 |
學術資源
•館藏資源
截至2015年4月，圖書館藏書56000部，包含藏醫、藏藥等，其中藏醫藥學古籍資料5千多卷；珍藏有公元7至17世紀的藏醫藥學和天文歷算學手抄本以及記載水銀提煉法的木刻版本；傳統藏醫藥教學彩色唐卡81幅；收藏有措如·才朗教授編撰的《四部醫典》全套錄像光碟和聲明學全套錄像光碟；每年訂購120多種期刊報類，共5千多冊，還擁有電子圖書1萬冊。從2005年開始實現了圖書借閱的電子化，並且建立健全了古籍文獻目錄庫。
•學術期刊
《藏醫藥教育與研究》由西藏自治區教育廳主管，西藏藏醫學院主辦。收集了以藏醫藥教育教學，藏醫藥理論，藏醫臨床實踐經驗，藏藥研究開發，醫院管理等內容相關的諸多具有一定學術價值的論文。
醫學體系
據2016年1月學校官網信息顯示，學校擁有1所直屬附屬醫院、1個藏藥廠、2個採藥認藥基地、5所教學醫院、1所非直屬附屬醫院、1個非直屬教學藥廠，1個傳統與現代相結合的實驗標本中心；其中學院藏藥廠成立於1996年，2004年通過國家GMP認證，生產藏藥品種達64種，其中24種藥品獲得國家批准文號，7個品種被列入國家中藥保護品種，3個產品被評為自治區名優產品，2個品種被評為國家技術創新優秀產品，列入“全國重點科技項目計畫”和“國家級火炬計畫項目”。
文化傳統
校標
校標如下：
校標校訓
厚德、勤學、篤行、利眾
西藏藏醫學院“厚德”，心胸寬廣不以個人得失為主，重公輕私，謂之厚德。《周易》中的卦辭：“天行健，君子以自強不息；地勢坤，君子以厚德載物”。《河南程氏粹語·論道篇》中說：“一德立而百善從之。”
“勤學”，是指勤奮學習，精益求精，學無止境。學習是學生的天職，在大學不僅要學到知識，更重要的是要學會“學習”，即擁有正確的學習態度和較強的學習能力。在同一所學校，師從同樣的教師，學習效果之所以存在差異，最主要原因就在於學習的態度和能力。而學習能力的獲得很大程度上依賴於學習態度。“勤學”，是同學們順利完成學業，做一名合格大學生的最基本要求。
“篤行”，源自《禮記·中庸》：博學之，審問之，慎思之，明辨之，篤行之。《禮記·儒行》：“儒有博學而不窮，篤行而不倦。”篤行是為學的最後階段，就是既然學有所得，就要努力踐履所學，使所學最終有所落實，做到“知行合一”。“篤”有忠貞不渝，踏踏實實，一心一意，堅持不懈之意。只有有明確的目標、堅定的意志的人，才能真正做到“篤行”。
“利眾”，就是知道照顧別人的人能夠生活得好,能夠有利於社會的人很長久。
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 黨委書記、副校長 | 周陽光 |
| 黨委副書記、院長 | 尼瑪次仁 |
| 副校長 | 普瓊、拉巴次仁（張金文）、米瑪、鞠明兵 |
| 紀檢委書記 | 王衍彪 |
