蕭功卓早年在直系軍隊任連長時，曾駐防於滄州。偶遇京西蓮花山武當下院蕭道長，蕭道長雖年逾半百，但武功卓絕，精於技擊，能將普通紙捻兒擲入木柱內寸余，足證其內力之深厚。因見蕭功卓骨骼清奇、氣宇不俗且恰和自己同宗共姓，氣息相投，遂親予點悟，收在門下並賜予道號“悟通子”，正式成為了一名武當弟子。師徒同食同寢數月，蕭道長密將武當金蟾子派‘智傳’（傳予玄裔弟子一路者稱‘智傳’，傳予俗家弟子一路者稱‘慧傳’）內外功法傾囊而授，蕭功卓一時武藝大進。數月間，蕭道長苦口婆心，幾番相勸，要蕭功卓捨棄軍職，隨自己南下武當，進修上乘功法。蕭功卓均已“親恩未報、功業未立”為由婉言回絕。臨別時，蕭功卓對恩師發下誓言，待得他年功成名遂之後，一定會拋家舍業，前往朝拜武當祖庭，再續師徒之緣，蕭道長頜首稱善，二人灑淚分別。
軍旅生涯間隙，他還結識了武術大師、孫氏太極拳創始人孫祿堂先生，交誼甚厚。二人若從八卦一門而論，孫為蕭之師叔；從形意一門而論，孫為蕭之師伯。維時在民國初年，河北永年太極拳大師、郝派太極拳創始人郝為真去北京探訪親友，臥病逆旅，幸得孫祿堂、蕭功卓等人慷慨救助，為其延醫治療，床前侍奉。郝為真為報孫、蕭搭救之恩，遂將其太極拳拳式、理法逐一演練明示。因而從郝派太極一門而論，二人則為師兄弟關係，其互相之倚重親近可略見一斑。
自從軍以來，蕭功卓目睹並親歷了舊中國干戈四起、軍閥混戰的黑暗現實和老百姓顛沛罹難、流離失所的苦難生活，在內心的極度矛盾和衝突之中，他開始對這種血雨腥風的戎馬生涯產生了厭倦情緒。在歷任要職後，最終毅然決然辭官隱遁，回歸故土。& X6 P2 S) l$ ]! t7 v
隱退之後，蕭功卓於保定廣交各方名士，他為人謙虛律己，從不以年長藝高驕人，以超邁的德行素養受到輩行推重，為地方公認的紳士。在武學方面更是全心研索，力圖精進。曾拜於趙慶祥先生門下習練深州派形意拳數年，朝夕鍛鍊，深得其中三昧。並受到尚雲祥、孫祿堂、趙振堯等前輩名家的指教。又與武當劍嫡傳名家陳聘清先生交好，得到武當劍單操和對練全部套路的真傳。兼收並蓄，遍覽斯道奧妙，一時成為保定知名的武術家，曾應師命受聘於當時的河北農學院（今河北農大），任武術教員。
此時的蕭功卓，自師從郝為真學習郝派太極以來已逾廿年。日常習武之餘，常思及當年楊氏（露禪）父子在京弘揚太極拳術，久負盛名，若只有一套太極拳未必撐得住門戶，想必另有不傳之秘。於是經年百計尋求，多方查考，冀觀全貌，惜其一直未能如願。直到舉家遷往北京之後，一日偶遇同門友人，言及太極大家富英先生之父富周老先生，恰是當年楊氏太極拳創始人楊露禪在清王府內的親傳高足，家學淵博，所學乃楊氏全部太極拳云云。正可謂因緣際會，蕭功卓聞之如獲至寶，遂親往拜謁，並於1937年拜於富英門下，開始習練府內派太極拳術，與富先生執父子禮，朝夕奉侍，受其親傳，苦修數載，同時得到王茂齋、恆壽山諸前輩的指導，最終將府內派楊氏太極拳的全部功法習練純熟。在富英處習拳期間，名手李瑞東先生之長子李博英慕富英之名前來比手。適逢蕭功卓在場，率先請戰，言曰博英若能取勝方可與富先生一試。結果李博英負於蕭手，遂亦拜於富英門下，而蕭亦回拜李瑞東先生為師。一時傳為佳話。從此，蕭功卓在學習府內派太極拳的同時，又習得李派拳術，武學日趨大成。
在京期間，除專心習武外，蕭功卓還結識了社會身份為北池子國小教員的中共地下黨員何潤剛，何潤剛請蕭功卓教授他和另外幾名地下工作者一些基礎的防身功夫，蕭功卓慨然應允、悉心教授，結果用了不到兩個月的時間，這些地下黨員就能夠基本做到從容對戰、防身有備了。在和何潤剛等同志的交往過程中，蕭功卓也對中國共產黨有了初步的了解和認識，大家相處的極為融洽。不久，駐紮在北京的日本特高科密探獲悉了這一訊息，認定蕭功卓有重大通共嫌疑，決定對其實施秘密抓捕。在月黑風高的一個夜晚，日本兵包圍了富家宅院，正在院裡練功的蕭功卓以其軍人所特有的敏感，細微的分辨出了馬靴踩踏和兵器撞擊所發出的聲響，他先以極快的速度溜到富英先生的窗下，壓低聲音和師父道別，未等富先生回音，鏇即施展自己平生所學的功夫，翻蹦跳躍、越脊竄房，狸貓般的消失在夜色之中，在黎明前混出了北京。返回原籍後，迅速帶領家人及親近弟子變賣了部分家資，遠奔他鄉，漂泊江湖，開始了漫長的流亡、避難生涯……
新中國建立後，蕭功卓舉家返回了故鄉保定，曾擔任過保定市武協教研組長等職務。他常年在蓮池和各大公園內義務教授武術，將一身拳法無償傳授給慕名前來請教的人們。他對學生關懷備至，誨人不倦，不僅傳授中華武術瑰寶，更尊尚武德，重視對個人品行的培養，使習武者不僅強身，更在心靈上受到傳統道德的教化。又因他為人性格開朗灑脫，待人謙和，不擺架子，從而追隨受學者益多。在教學中，他更結合自身多年經驗，在繼承楊式府內派太極拳的基礎上對其進行改革，使之更符合人體生理特點和技擊的力學原理，如把太極治架由原來的弓蹬步改為三體勢步，不僅更切合技擊實戰的需要，而且形成了蕭氏特有的風格；將原來的向上提肛動作改為向前收臀抱胯，更易於做到氣沉丹田，有利於身體的上下相合和內氣運行等。經蕭功卓改進後的太極拳不但更符合技擊的原理，而且對於內功的修煉也更有助益，使練習者便於掌握，易上功夫。除改進傳統太極拳外，蕭功卓也結合實踐，對形意拳、八卦掌和通背拳做了有益的更進。他還親手編寫了“內家拳拳譜”、“八卦掌要訣”、“十三總勢歌訣”等武術專論文章，精簡舊譜，刪去繁難，以便於後學習練掌握。經他親手推敲、修改過的祖傳舊譜，變得精當易懂，成為系統、規範的參考資料，不僅大有益於後學，更對中國傳統武術的發展傳承做出了不可磨滅的重要貢獻。
1979年冬，蕭功卓忽然感念起當年對武當蕭道長所發的誓願未能實現，遂悶悶不樂、鬱鬱寡歡起來，但是每日仍待客演武不輟，直至臨終前一天晚上，還在教習武當地盤劍到深夜兩點多鐘。第二天上午又繼續教人練拳，與常無異。至下午五時，於家中浣洗素服，盤膝坐逝、含笑而去，身骨柔軟、面色如生。臨終前囑以家人，墓碑但鐫“武當志士蕭功卓之墓”即可，並要求他日下葬時，必須頭朝武當方向，以示應約赴感之意！
後輩學人每談及此，皆謂實乃其德劭功著、學修有成所致。生前之傳奇軼事，至今仍為市井坊間所樂道……
