菜心軟腐病是常發病害，尤其是高溫多濕的季節或棚室均常發生，常減產20%～30%。症狀多發生在成株期，易從葉柄基部傷口處侵入，初呈半透明水浸狀，擴展後常變成淺灰褐色，造成葉柄組織呈黏滑軟腐狀，並散發出硫化氫臭味。此病向葉柄基部擴展，造成組織腐爛，引起植株中午萎蔫，起初早晚尚可恢復，病情嚴重時不再恢復癱倒在地。
病原Erwiniacarotovorasubsp.camtovora(Joncs)Bergcyetal.稱胡蘿蔔軟腐毆文氏菌，胡蘿蔔軟腐致病變種，屬細菌界薄壁菌門，病菌形態特徵，此菌在培養基上的菌落灰白色，圓形或不定形；菌體短桿狀，大小0.5～1.0×2.2～3.0μm，周生鞭毛2～8根，無莢膜，不產生芽孢，革蘭氏染色陰性。本菌生長發育最適溫度25～30℃，最高40℃，最低2℃，致死溫度50℃經10分鐘，在pH5.3～9.2均可生長，其中pH7.2最適，不耐光或乾燥，在日光下曝曬2小時，大部分死亡，在脫離寄主的土中只能存活15天左右，通過豬的消化道後則完全死亡。本菌除為害十字花科蔬菜外，還侵染茄科、百合科、傘形花科及菊科蔬菜。傳播途徑和發病條件該菌在南方溫暖地區，無明顯越冬期，在田間周而復始、輾轉傳播蔓延。在北方則主要在田間病株、窖藏種株或土中未腐爛的病殘體及害蟲體內越冬，通過雨水、灌溉水、帶菌肥料、昆蟲等傳播，從菜株的傷口侵入。此外，有報導，軟腐病菌從菜心幼芽階段起，在整個生育期內均可由根毛區侵入，潛伏在維管束中或通過維管束傳到地上各部位，在遇厭氣性條件時才大量繁殖引起發病，稱之為潛伏侵染。菜心潛伏帶菌率有時高達95%。由於軟腐病菌寄主廣，經潛伏繁殖後，引起生育期或貯藏期發病。該病從春到秋在田間輾轉為害，其發生與田間害蟲和人為或自然造成傷口多少及黑腐病等有關。菜心的傷口主要分自然裂口、蟲傷、病痕及機械傷等，其中葉柄上自然裂口以縱裂居多，是該病侵入主要途徑。生產上久旱遇雨，或蹲苗過度，澆水過量都會造成傷口而發病。地表積水，土壤中缺少氧氣，不利菜心根系發育或傷口木栓化則發病重。此外，還與菜心品種、茬口、播期有關。一般白幫系統、連作地或低洼地及播種早的發病重。
防治方法(1)選用抗軟腐病的菜心、紫菜薹品種。如五彩紫薹2號。((2)及早騰地、翻地，促進病殘體腐爛分解。(3)仔細平整土地，整治排灌系統，非乾旱地區採用高畦直播，南方深溝高廂種植。(4)實行溝灌或噴灌，嚴防大水漫灌(5)適期播種，大力推廣帶狀種植，避免施肥打藥等農事操作造成人為傷口。(6)種子藥劑處理和噴淋。方法有：①用“豐靈”50～100g拌菜心籽150g後播種，或採用2%中生菌素，按種子重量的1%～1.5%拌種；②苗期噴灑3%中生菌素可濕性粉劑800倍液或“豐靈”每667平方米100～150g，加水50L；③用“豐靈”150～250g對水100L，沿菜根挖穴灌入，或在澆水時隨水滴入3%中生菌素，每667平方米2.5～5L。由於該病苗期侵染期長，侵染部位多，在間苗或二次定苗時再防1次，有利提高防效。(8)噴灑3%中生菌素可濕性粉劑800倍液或72%農用硫酸鏈黴素可溶性粉劑3000倍液、50%氯溴異氰尿酸可溶性粉劑1200倍液、或25%絡氨銅·鋅水劑500倍液、20%噻森銅懸浮劑300～500倍液，隔10天1次，連續防治2～3次，還可兼治黑腐病、細菌性角斑病、黑斑病等。但對銅劑敏感的品種須慎用。
