功能
正常生理狀態下，正常的腸道菌群對人體的 維生素合成、促進生長發育和物質代謝以及免疫防禦功能都有重要的作用，是維持人體健康的必要因素，也是反映機體內環境穩定的一面鏡子。
作用
保護作用
腸道菌群具有保護宿主正常的組織學和解剖學結構作用。
營養作用
宿主所需的維生素、胺基酸、脂質和碳水化合物都可以從正常的腸道微生物群獲得。包括 B 族維生素、維生素 K 、泛酸、葉酸等。
參與代謝
主要體現在內源蛋白質等的代謝需要微生物菌群直接參與，腸道細菌產生β一葡萄糖醛酸酶、硫化酶等，間接或直接為宿主利用。
促進吸收
正常腸道菌群，有促進腸道蠕動功能，能促進機體對營養物質的消化吸收。
屏障作用
菌群屏障作用又叫定殖力，是機體免受外來細菌感染的一個可靠保證，分為預防性屏障作用和治療性屏障作用。前者指屏障菌群首先定殖，使屏障作用的對象無法在腸道定殖，對抵禦外來感染起一種預防和保護作用。後者指：雖然屏障作用的目標菌株在腸道中的定殖先於屏障菌群，但後來的屏障細菌可以將其從腸道中驅除，類似於化學藥物的治療作用。
防癌抑癌作用
研究發現厭氧棒狀桿菌，不但不會致病，還可激活人體內免疫細胞，提高吞噬能力，具有抑癌作用。
