肛瘺有原發性內口、瘺管、支管和繼發性外口。內口即感染源的入口，多在肛竇內及其附近，後正中線的兩側多見，但也可在直腸下部或肛管的任何部位。瘺管有直有彎，少數有分支。外口即膿腫潰破處或切開引流的部位，多位於肛管周圍皮膚外，由於原發病灶不斷經內口進入管道，加之管道迂曲行走於內、外括約肌附近，管壁由纖維組織構成，管內有肉芽組織，故經久不愈。
一般單純性肛瘺只有一個內口和一個外口，這類最多見。若外口暫時封閉，局部引流不暢，則又逐漸發生紅腫，再將形成膿腫，封閉的外口可再穿破或在其他處形成另一外口。如此反覆發作，便病變範圍擴大或有時造成幾個外口，與內口相通，這種肛瘺稱為複雜性肛瘺，即有一個內口與多個外口。但有人認為，複雜性肛瘺不應以外口的多少劃分，而是指主要管道累及肛管直腸環或環以上者。雖然這種肛瘺只有一個外口及一個內口，但治療比較複雜，故稱為複雜性肛瘺。相反，有時肛瘺雖有多個外口，但治療並不複雜。
分類
根據瘺管與肛門直腸四面間隙的聯繫，以及病理變化和治療上的便利分以下種類：
①皮下或黏膜下肛瘺
a.皮下瘺，是指原發內口在肛竇，瘺管在肛門管皮膚下或肛門四麵皮膚下的淺在性肛瘺，外口距肛門很近。
b.黏膜下瘺，系指原發口在肛竇，瘺管在肛門管直腸黏膜下，皮膚外沒有開口。
②內外括約肌間肛瘺
a.低位肌間瘺管：指內口在肛竇，瘺管穿至內外肛門括約肌間隙，穿過外肛門括約肌皮下部的肛瘺。而瘺管走向直，只有一個外口的，稱作單一性低位肌間瘺。而走向彎曲，有支管的稱為複雜性低位肌間瘺。
b.高位肌間瘺管：指內口在肛竇，瘺管至內外括約肌間向上進展的肛瘺。
③肛提肌下肛瘺
a.低位肌外瘺管：指內口在肛竇，瘺管穿過肛門外括約肌淺部的肛瘺。向一側坐骨間隙進展的稱為單一性低位肌外瘺。向兩側坐骨直腸間隙進展，產生像馬蹄鐵外形，肛門兩側都有外口的稱為複雜性低位肌外瘺，又叫低位蹄鐵形肛瘺。
b.高位肌外瘺管：指內口在肛竇，瘺管穿過肛門外括約肌深部的肛瘺。向一側坐骨直腸間隙進展的稱為單一性高位肌外瘺，向二側坐骨直腸間隙進展的稱為複雜性高位肌外瘺，又叫高位蹄鐵形肛瘺。
④肛提肌上肛瘺
指內口在肛竇或齒狀線上方肛管直腸壁上，瘺管由肌間隙進入骨盆直腸間隙，穿過肛提肌的高位肛瘺。
肛瘺手術前要注意什麼：
1、瘺手術前徘空大便，有便秘史者囑服蜂蜜、麻油或潤腸藥物，或取番瀉葉十克泡茶頻服。仍無效時應給予清潔灌腸。
2、肛瘺手術前要告知病人什麼食物是必需要禁食的，不少病人因懼怕手術後大便，自行禁食，輕易在術中、術後導致低血糖反響，應予糾正。骶麻、鞍麻、連硬麻醉應按要求告知病人，手術前晚起禁食。
3、在肛瘺手術前病人感到焦慮、懼怕，主要是由於害怕疼痛。有的由於以前手術治療失敗，或者擔憂手術是否順利，害怕不能一次勝利。
4、肛瘺手術前常規丈量並記錄各項生命體徵，不正常者應及時報告。
