宗教人生
入教後，羅文藻以傳道員身份，隨利安當到南京傳教。傳教受阻，未及一年即返回福州。曾赴台灣傳教。崇禎十年，又隨方濟會神父赴北京傳教，因明廷查禁，又折回福州，曾一度被福州當局收監，獲釋後回福安，仍熱心教務，翌年被派到澳門傳教。
羅文藻主教 明崇禎六年（1633年），多明我會士黎玉范與方濟各會士利安當來福安宣教。是年秋，羅文藻在利安當帶領下“受洗”，歸入主的名下，並以“額我略”為聖名。之後，羅文藻隨利安當到南京傳教。因發生“禮儀之爭”，傳教受阻，未及一年即返回福州。據說一度赴馬尼拉傳教。崇禎十年（1637年），又隨方濟各會神父赴北京傳教，在此羅文藻受到湯若望器重，湯有意讓他到朝鮮宣教。但因明廷查禁，羅曾一度被朝廷收押，獲釋後回福安，仍熱心從事傳教。不久，福建教會遭到打擊，羅文藻被迫到澳門宣教。
明崇禎十七年(1644年），羅文藻隨黎玉范前往菲律賓馬尼拉，向多明我會報告中國教務。並在多明我會主辦的聖多瑪斯學院半工半讀。南明永曆元年(1647年）奉多明我會會長多明戈·岡薩雷斯之命回國，在福建協助艾儒略傳教。同年，他在福安藤（頂）頭購地籌建藤頭教堂。永曆四年(1650年），在藤頭加入多明我會，成為中國第一位多明我會士。 永曆六年（1652年）春，羅文藻第三次赴馬尼拉，在聖多瑪斯學院繼續攻讀神學、哲學。永曆八年（1654年），在馬尼拉城由鮑布來德主教祝聖為司鐸，成為神父。翌年，受派返回中國傳教。永曆十年（1656年），福安沿海海盜猖獗，到處抓人索取錢財。羅文藻為贖回被抓走的人質奔波了半年之久。由於他為百姓做了好事，並積極傳播教義，許多人因而受洗歸主。
聖多瑪斯大學 清順治元年(1644年)，羅文藻隨黎玉范神甫到菲律賓馬尼拉，向多明我會報告中國教務，事後返澳門。順治二年，又隨安多尼神甫到馬尼拉，獲準入聖多瑪斯學院深造。順治四年回到福建協助艾神甫傳教。同年，他在福安藤(頂)頭購地籌建藤頭教堂。順治七年，在藤頭加入多明我會，成為中國第一位多明我會會士。 順治九年春，羅文藻第三次赴馬尼拉，在聖多瑪斯學院繼續攻讀神學、哲學。順治十一年，在馬尼拉城由鮑布來德主教祝聖為司鐸，成為神甫。翌年，受派返回中國傳教。順治十三年，福安沿海海盜猖獗。到處抓人索取錢財。羅文藻為贖回被抓走的人質奔波半年之久。由於他為百姓做好事，積極傳播教義，許多人因而受洗入教。
康熙四年(1665)羅文藻第四次去馬尼拉，籌措傳教經費，並受當地多明我會、方濟各會和耶穌會之託，回國視察各省修會所轄教務，遍歷閩、浙、贛、粵、晉、魯、湘、川及江南（包括今江蘇、安徽兩省）、直隸（今北京、天津兩市，河北大部和山東、河南小部分地區）諸省。羅文藻在兩年內帶領三千多人受洗歸主。
康熙八年（1669年），清廷禁止天主教，外籍主教聯名上書羅馬教宗，要求提升羅文藻為主教，管理中國教務。教廷雖早在1658年即已準備在中國實行宗座代牧制，但因西、葡兩國的反對而作罷。1674年教宗克雷芒十世任命羅文藻為巴希利主教（具銜）、南京教區宗座代牧。3年後，他接到委任書，為避免與葡萄牙保教權發生矛盾，遂上書謙辭。教廷勉其從命，指示他前往馬尼拉受祝聖。到馬尼拉後，多明我會駐馬尼拉省會長嘉德朗反對為其祝聖，並命他在當地華僑中傳教，不準回國。後羅文藻得到奧斯定會幫助，潛行返國。康熙二十四年四月八日（1685年），羅文藻在廣州由方濟各會義大利主教伊大任為其祝聖，成為第一個中國籍主教，掌中國北部諸省教務。同年六月，羅文藻到南京任職。到任後即上書教宗，希望寬免中國籍神父讀拉丁文的要求，使中國人能更容易提升為神父。又要求豁免教士們要發誓聽從主教的命令。南京教區的經濟來源主要靠教廷傳信部少量撥款，並常受諸外國修會剋扣。由於羅主教不受葡萄牙保教權的節制，未經葡萄牙國王的同意，向教宗舉薦義大利人方濟各會余神父為副主教。多明我會斷絕一切接濟，羅主教因此缺乏經費，而無法巡視教務。康熙二十七年(1688年)，他祝聖萬其淵、吳漁山、劉蘊德等三位中國籍神父。康熙二十九年(1690年)，羅馬教宗宣布在中國成立北京和南京兩個主教區，與澳門分立，羅文藻被任命為南京教區主教。同年十月間，羅文藻突患重病，於次年二月安息主懷。
康熙十八年，教皇依諾增爵十一世重新任命羅文藻為南京主教，教廷傳信部及多明我會總會也勸他接受，羅文藻欣然應允。但因教皇的任命狀尚未到達，故祝聖事未能如願。康熙二十三年，他回到福安穆陽，打算到巴盧主教處接受祝聖，但到達穆陽教堂時，巴盧主教已去世。 康熙二十四年，義大利籍主教康和之持教皇手諭從馬尼拉來華，於四月八日在廣州城外方濟各會堂為羅文藻舉行祝聖大典。自此，他成為中國第一任華籍主教。同年六月，羅文藻到南京視事。到任即上書羅馬教皇，希望寬免中國籍神父讀拉丁文的要求，否則中國人就無法提升為神父；又要求豁免教士們要發誓聽從主教的命令。在敬祖敬孔的問題上，他雖遵從羅馬教廷的禁令，但在執行時卻能按照中國的民情，予以緩和。他不受葡萄牙保教權的節制，未經葡萄牙國王的同意，向教皇舉薦義大利人方濟各會神父良尼沙為副主教。康熙二十七年，他又親自為吳漁山、劉蘊德、萬其淵三位華人祝聖為神父。
康熙二十九年(1690年)，羅馬教皇宣布在中國成立北京和南京兩個主教區，與澳門分立，羅文藻為南京教區主教。同年十月間，羅文藻在巡視教務途中，突患重病，轉回南京。康熙三十年病逝，葬於南京雨花台。
紀念
位於台灣高雄市的文藻外語學院，即以紀念羅文藻主教而命名。
