種子雨的組成和大小具有時空異質性。種子雨的空間異質性表現在種子雨的組成和大小因群落而異,種群間的種子雨因種群而異,種群內部的種子雨因個體而異;種子雨的時間異質性表現在不管是群落、種群還是種群內部的個體,其種子雨既具有季節動態,又具有年際變化。
種子雨、種子庫、幼苗庫和地上植被相互聯繫、相互作用。種子雨的研究對更好地了解種群和群落動態等具有重要意義。套用現代的分子遺傳標記技術、同位素標記法和螢光染料法等研究種子雨的散布過程和種子命運將是未來種子雨研究的熱點,種子雨和種子庫的結合研究及其與動植物關係的研究尚需加強。