至隋滅陳，由於全國重新統一，建康不再作為都城，破岡瀆的漕運作用隨之喪失，逐漸退出歷史舞台，但直到唐代前期其水尚未斷流。破岡瀆完全淤塞可能在唐代晚期。
史料記載
三國時，據有江東的東吳，最初建都在京口(今鎮江)；而東吳的主要經濟區在太湖流域，此時利用原有的運道，就能解決京口與東南諸郡的聯繫。東吳後來定都建業(今南京)。這時，如若照舊利用原有水道，就只有借長江江流聯繫建業與京口了。但是這一線路要通過長江，特別是其中的鎮江河段有風濤之險。為解決這一困難，在赤烏八年(公元二四五年)，孫權便派遣陳勛率屯田等兵士三萬人開鑿句容中道，就是有名的破崗瀆。這條運河起於小其(在今句容東南，有破崗埭，離城二十五里)，向東穿過山崗，越鎮江南境，到今丹陽境內的雲陽西城(在今丹陽縣延陵鎮南)。與原有運道銜接。東吳役使三萬兵開鑿這一山崗，可見工程之龐大與艱巨。山崗開斷後，河道縱坡仍很陡，只好沿途修建十四個用以蓄水的埭①[註：《太平御覽》卷七十三，堰埭條，引《吳錄》作“開水道立十二埭”。]。由於渠身不夠寬敞，每值冬春，行船不便，到梁代時便廢棄了。梁代又在其南另開了一條“上容瀆”。該運河從句容縣東南五里的地方開始，實行“頂上分流”：一支東南流，長三十里，沿程築了十六個埭，都在丹陽界內；一支西南流，長二十里，沿程築了五個埭。出句容界，西流入秦淮河，轉入長江。到陳朝，上容瀆也堙塞，轉而修復破崗瀆。到隋文帝平陳後，把建康城徹底平毀，因而二瀆也廢了。
作用
吳國從京口(鎮江)遷都建鄴(今南京)後，從蘇杭一帶調運軍需進京，增加了一百多公里路程。為保證都城需要，縮短運輸里程，避開長江逆行風險，同時也是防範曹操水軍襲擊，吳國開鑿了這條便捷航道，對儲蓄水源，調節水利，開發赤山湖，促進句容中東部地區的經濟文化發展都起過積極作用。
隋開皇年間，遷都西安，破崗瀆地位下降，但在一段時間內仍能通航。唐武德七年(624)輔公柘起義失敗，曾從江寧經破崗瀆敗走丹陽。唐大曆年間，顏真卿在《送劉太沖序》的詩中寫道：
江月弦魄，秦淮頂潮。
君行句溪，正及春水。
說明春汛期間破崗瀆尚可季節通航。隨著時間的推移，破崗瀆終至湮沒
