植物營養與施肥；土壤-植物體系養分管理；養分循環與環境質量；土壤肥力與肥料。
教學及獲獎情況：
主講植物營養專業碩士研究生學位課《植物的土壤營養》，已培養碩士研究生18名、博士研究生3名；主編和參編教材4本：《肥料學》、《土壤肥料學》、《試驗設計與統計分析》、《植物的無機營養》；參加專著編寫3本：《中國土壤肥力演變》、《中國含氯化肥》、《中國土壤生物演化及安全評價》；主編科普書3本《主要農作物配方施肥》、《蔬菜施肥》、《肥料科學施用指南》。
科研及獲獎情況:
先後主持和參加各級科研課題29項，在西南地區主要作物高產高效養分最佳管理、主要糧食作物配方施肥技術、紫色土肥力監測、菸草營養與施肥、柑橘營養與施肥、水旱輪作體系養分循環特徵與環境質量等方面開展了系統研究，建立了紫色土區水稻、小麥、玉米、菸草等主要作物的配方施肥技術模式，獲得各級獎勵8項：
1、“重慶市菸草平衡施肥技術研究與推廣套用”，2006年獲重慶市政府科技進步二等獎（主持，排名第一）；
2、“紫色土稻麥配方施肥模式推廣套用”，1992年獲國家教委科技進步二等獎（主研，排名第七）；
3、“含氯化肥科學施肥和機理的研究”，1998年獲國家科技進步二等獎（參加，二級證書）；
4、“川東丘陵農業增產綜合技術試驗研究”，1998年獲重慶市科技進步獎三等獎（參加，二級證書）；
5、“高產糧棉菜中量、微量元素組合的作物營養與效應研究”，1997年獲農業部科技進步獎 三等獎（參加，二級證書）；
6、“四川省科技增糧示範工程”，1997年獲四川省先進個人三等獎；
7、“摻合肥料施用技術”，1992年獲化工部科技進步獎二等獎（參加，二級證書）；
8、“國家土肥長期監測基地建設的技術體系研究”，1992年獲中國農科院科技進步獎二等獎（參加，二級證書）。
在研項目：
1、 西南地區優勢作物(柑橘、水稻)最佳養分管理技術研究與套用(國家公益性行業科研專項，項目編號：200803030，經費：85萬，起止時間：2008.01-2010.12)，主持。
2、 西南地區主要作物高效專用複合肥配方研製及示範推廣（國家科技支撐計畫，課題編號：2006BAD10B08，經費：25萬元，起止時間：2006.01-2010.12，）專題主持。
3、 潛育型紫色水稻土質量調控關鍵技術集成研究與示範（國家科技支撐計畫，課題編號：2006BAD05B06，經費：20萬元，起止時間：2006.01-2010.12），專題主持。
4、 紫色土土壤肥力與肥料效益監測及數據信息系統建設（國家科技部基礎平台建設項目，課題編號FS2005-6，經費：50萬，起止時間2006-2010），主持。
5、 種植業污染源普查--地下淋溶長期監測（農業部重點項目，課題編號：WX-Z-20-2，經費：45萬，起止時間2007-2011年），專題主持。
6、 菸草有機-無機專用肥料研製及產業化關鍵技術研究（重慶市科委重點攻關，編號：CSTC2008AB1028，經費：30萬，起止時間：200801~201012），主持。
7、 重慶主要植煙縣測土配方施肥研究（重慶市菸草公司，經費：75萬，起止時間：2009-2010），主持。
8、 巫山、酉陽優質特色菸葉生產研究（湖南中煙工業公司，每年經費200萬），主持。
近四年代表性論文：
1. 李學平,石孝均*. 紫色水稻土磷素動態特徵及其環境影響研究. 環境科學, 2008, 29(2):434-439
2. 李學平,孫燕,石孝均*.紫色土稻田磷素淋失特徵及其對地下水的影響.環境科學學報,2008,28(9)：1832-1838
3. YANG Yong-kui, ZHANG Cheng, SHI Xiao-jun, LIN Tao, WANG Ding-yong*. Effect of organic matter and pH on mercury release from soils. Journal of Environmental Sciences, 2007,19(11):1349–1354. （SCI收錄，IDS Number: 232QZ）
4. 李學平,石孝均*.長期不均衡施肥對紫色土肥力質量的影響.植物營養與肥料學報,2007,13(1)：27-32
5. 和林濤,石孝均*,易時來.不同氮處理下紫色土鉀素淋失動態研究.西南大學學報（自然科學版）,2007,29(7):096-101
6. 溫明霞,官會林,石孝均*.榨菜葉還田對土壤肥力的影響研究.土壤通報, 2007,38(1)：34-38
7. 石孝均,霍沁建,關博謙,吳躍明,李常軍,和林濤,代先強.重慶市烤菸氯素營養研究.西南大學學報（自然科學版）,2007,29(3)：74-80
8. 林陶，張金洋，石孝均，王定勇*. 三峽水庫消落區土壤汞吸附解吸動力學特徵. 環境化學，2007，26(3):302-306.
9. Peijuan Cao, Dingyong Wang, Cheng Zhang, Xiaojun Shi*. Release Characteristics of Mercury from Soil in Rice-wheat Rotation Systems. The eighth International Conference on Mercury as a Global pollutant. DEStech Publications, Inc, 2006, p306. （ISTP收錄）
10. 易時來,石孝均*.油菜生長季氮素在紫色土中的淋失 .水土保持學報,2006,20(1):83-86
