咒文釋義
一、嗡、班雜爾灑埵灑嘛雅 [註解]呼其名及灑嘛雅。此處灑嘛雅意為誓句、大願及戒律。無論何時一尊名被呼，則其高尚的品格即與之完全相連而蒙召感；無論何時任何人祈請及本尊的灑嘛雅，其誓言即化為行動，而其大願則圓滿達成，其戒律即依其真正傳統而持守，毫無變更。如果僅稱其名而不及其誓句，他可能降臨但不一定真正相助；如果作兩者都呼籲，則他必須幫助你，因其願已被同時祈請。正如你呼喚愛人之句，她會來救你，但如果你說：“你還記得當我們初見之時，你說：‘愛我當如細水長流’”（誓句）。她會記得而立刻擁你、吻你！我們敬愛我們的本尊亦應如是：他經常依照他的誓言來加持我們。這是無可置疑的。
二、嘛努把拉雅 [註解]請讓我不要忘記我純真的自性，或者，由於你的誓句，請保持我於純真的自性，即空性之中。這是有關於觀空的。當一個人住於空性時，他是被本尊所保持的，他與本尊同體。他永不為本尊所遺忘。他與本尊合一。
三、班雜爾灑埵、得裸把底叉 [註解]請賜我成就金剛薩埵。此處金剛薩埵指金剛總持，他是五方佛的上師。這是一種菩提心，在修任何一法之前必先發起的。為救所有眾生，必先成佛方能從事所有神聖的救度事業。又據說《百字明》可用以補足任何儀軌之任何欠缺。
四、知卓麥把哇 [註解]請堅定我的空性。這顯然地指出應堅定地住於空性，所有觀想有如層層樓房築基於空性之磐石上。
五、蘇埵喀約麥把哇 [註解]請賜我瑜伽之受用。此與三灌之金剛愛有關，亦即紅觀音之密修。然而白觀音之空悲雙運亦屬一種瑜伽之受用。
六、蘇波喀約麥把哇 [註解]請賜我不違背空性，就是說，縱在大樂中仍能配合空性。米拉日巴尊者對金剛愛之秘密教授強調：“大樂生起時要享受空性，空性生起時要享受大樂！”此處雖然我們只談到觀想，我們在觀想由空性緣起之事物時，應保持空性，並且在想到空性時，保持觀想。至於空悲不二，我得更加仔細解釋，因為它的極端重要性影響所有過去諸佛之證果，並為所有古德所強調者。 凡夫之圓覺乃為罪所障。事實上每一個人違背空性時多多少少有罪。罪因即是不能保持空性而放棄之；犯下以自我為中心的無明煩惱而造損人之惡業。了知違背空性之危險，一個人就永不會造罪。當一個人住於空性時，彼即無自我，又何必要去造罪？當一個人的自我消失時亦無有他人，更有何人可被損害？此亦為大悲之根源。由眾生共有之空性本體而在個人心中喚醒同體大悲。誰會以己手自傷其腿？此亦為無緣大悲之根源。這不是像一個丈夫只愛其妻。當所有眾生同體則不需其他特殊條件。一個人不會說：“我眼屬我，但我鼻則屬於他人。”因這我們皆是同一體之各部分，我們應愛護它。空性與十法界是同一體，而十法界是一個比宇宙或世界更廣大之名詞。 有云：修空圓滿時得證大悲，修悲圓滿時可證空性，空性之中“無我”、“利他”即是大悲，二者有相同之特性，有如一張紙的兩面，當一個人能夠無我，也必能利他。前者是空性而後者是大悲，二者是統一的。
七、阿努惹埵麥把哇 [註解]願我不失樂之本體。此樂之本體即空性；樂本身是一種空性緣起。第六句所說，一個人不應違背空性，是指空性之本體，而此第七句則是關於空性的緣起。如米拉日巴尊者所教授者，此二者必須圓融為一。一般而言，每一緣起均應與空性配合。
八 、灑哇司底、麥札雅叉 [註解]請賜我圓滿成就。這是綜合所有救度事業而言，除證空性之外，所有其他均直接或間接與大悲有關。整個修持與每一眾生有關且為彼等回向。我為眾生而禮拜；我為眾生而供養；我為眾生而念誦；我為眾生而懺悔；我為眾生而贊佛或本尊；當所有各節已修畢，應淨此功德完全回向所有眾生。如此大悲可經由這些而達到。
九、灑哇嘎嘛蘇雜麥 [註解]請賜我所有善行之自在。當行者下座而明顯地成為本尊於日常生活中，他事實上所有親戚、朋友、宗族、家人與整個社會聯繫起來，並以種種善行幫助他們。他應以本尊之行為為已行，以本尊之語為已語，以本尊之意為已意。在其善行中沒有自私與無明的障礙。行者在積集功德上得自在，此即此句咒語的含意。
十、資擋洗爾養古汝吽 [註解]請賜我金剛心之大勇。此亦即請求最重要的菩提心；此心含有大勇，使修法和日常生活中皆能實行大悲。一個人為何膽怯？當作善事時，他使“我不敢”耽誤了“我願”，因為他鄙俗嗎？因為他有自我和自私。他有以自我為中心的欲望，所以他怕失去他所欲求的。他已隔離空性。當他住於空性中時，我執已除，因此無欲，因而變成勇猛如獅，堅強如銅；他即是能為一切眾生作所有善事的一尊金剛薩埵。因此西藏佛教稱所有男性為勇父，女性為勇母。大勇是每一行者所必備的，尤其是在此邪魔充斥的末法時期。
十一、哈哈哈哈火 [註解]請引導我得五智及其切用。梵文“哈”字有任何事情之因皆不可得之意。這五個哈字（最後火字亦為哈字為字根）代表空性之五智。
十二、把嘎哇吶、灑哇打他嘎打 [註解]所有諸佛菩薩請勿舍我於汝等之大事業外。此特定句意含懺悔與贖罪之功用。有雲，如要懺悔還淨，應誦《百字明》咒。但此咒全體並不足為懺悔與贖罪，如以上所說明者。此句包含大危險，但此含意少有人知。因此必須指出，我們淪於人道或其他眾生道是由於離開神聖的諸佛菩薩之大事業而開始。不斷的輪迴不會停止，直到我們再回到諸佛菩薩的大事業，我們就罪業得消，本性回復，與空性合一，並且大悲得以滋長。
十三、班雜爾嘛麥母雜、班雜爾把哇 [註解]或離汝等之金剛自性。此處金剛自性即指空性。凡人極易背空性，再者人在行善時或有偏執，亦是違背金剛自性。
十四、嘛哈、灑嘛雅灑埵 [註解]令我住於廣大空性之甚深三摩地。通常儀軌于歸空之後，要行者修大手印定。此種空乃是一種直接與法身光明合一之甚深三摩地。因此，在觀想中所放諸光，或在觀空中法身之根本常寂光，皆與此咒有關。
十五、阿、吽、呸
[註解]請賜我證空性“阿”，佑我得大悲之利用“吽”及降魔“呸”。此最後三字有上述之三種功用。所以在修空性三摩地時，此咒可止於頭一個字“阿”。有時為救度他人，則可止於第二個字“吽”。如欲降魔，則高聲誦第三個字“呸”，以誅魔或退魔。
持誦《百字明》以作為四加行之一時，則以第一字“阿”結尾，因為“阿”為空性種子，可淨除一切罪。
簡單全解
主尊金剛薩垛，請您以及您身口意的極深秘密誓言恆時守護、保佑我們。
主尊金剛薩垛，請您的加持成就安住於我，並讓我與您無二無別。
請賜我以無漏、大樂的智慧，令我滿足。
令我證悟光明的智慧。
請你慈悲地愛護、憐憫我。
請您立即賜予我清淨一切罪業、及其一切殊勝的成就。
讓我心地賢善地行持一切事業。
令我現前四種灌頂的智慧。
祈請一切出有壞如來，請您身口意的智慧在方便與大悲無別之中，恆時不要捨棄我。
讓我的身口意成為佛的身口意而成佛。
恆時不離開沒有世間分別的法界，金剛薩垛主尊，請令我成就一切如來在不生不滅的法界中感受平等法味， 一體的智慧。
咒語功德
百字明咒的功德主要是消減罪障，就像洗澡可以洗淨身體，百字明咒則可洗淨我們的罪障，讓我們得到更純淨的力量。
「百字明咒」具足了無邊的力量，但念誦的人若沒有信心和菩提心的話，那么這咒語的力量就非常的難以得到成就。如果你想要讓念誦咒語的力量實現的話，就得如法的去修習。密經里談到：有可能虛空會消逝，密咒的成就卻永遠不會消失。
常誦此咒有下列功德：
◎能懺悔及消除無始以來之罪業。
◎能止一切惡念，令不增長。
◎能破除一切煩惱。
◎能增長無量無邊之福智。
◎能生種種功德，於修法後，能加誦此咒若干遍，所有修法時，偶有過失錯誤遺漏之處，諸佛菩薩不將為咎。
◎隨願所求，事事如意。
金剛薩埵百字明功德
修行者又慮恐承事供養之中，或有忘誤疏遺，犯三昧耶禁。或有多生宿業罪障由未消除，誦『金剛部百字真言』，以補前潛滅除諸過，得身心清淨，與法相應。……誦『百字真言』，能除無始已來一切重罪，破四重禁五無間業罪謗方等經，如是等罪悉皆消滅，何況誤失小過而不清淨。─《金剛童子持念經》。──《大正藏》第二十一冊頁134下─135上。
誦『金剛百字真言』，假使過去世中造種種惡業，五無間等一切罪障，由此百字真言加持故，一切罪障悉皆銷滅，現身獲得「首楞嚴三昧」。若心散亂數誦此真言，或一七三七乃至一百八遍，速與三昧相應。……此真言有大威力，修行者設犯三昧耶，觀念不次，或惛沈掉舉所犯愆過，由數誦此真言加持故，能令行者具足『上品功德』，補前犯不成過增益，威力速與三摩地相應。─不空譯《金剛頂經瑜伽文殊師利菩薩供養儀軌》。──《大正藏》第二十冊頁722中─下。
由此「摩訶衍百字密言」加持故，設犯五無間罪及謗一切諸佛方等經典，如是等罪悉令消滅，以本尊堅住已身故，速獲「金剛薩埵」位，及獲「菩薩諸佛」位。─《金剛頂經瑜伽觀自在王如來修行法》。《大正藏》第十九冊頁78下。「若人得聞金剛薩埵名字及見身者。於七生中得最上地。」
─大正新修大藏經 第十八冊 No. 887《佛說無二平等最上瑜伽大教王經》
由以摩訶衍那百字真言加持故。設犯五無間罪。謗一切諸佛及方廣經。修真言者。以本尊堅住己身故。現世所求一切悉地。所謂最勝悉地。金剛薩埵悉地。乃至如來最勝悉地。
-金剛頂經瑜伽修習毘盧遮那三摩地法(金剛智譯)
誦此陀羅尼。能令聖者歡喜。堅固菩提，所求勝願，能速成就。
─《金剛頂經曼殊室利菩薩五字心陀羅尼品》(金剛智譯)
復誦百字真言。為自擁護身口意業。
-佛說大摩里支菩薩經卷第六(天息災奉詔譯)
由以百字真言奉閼伽水故。所有願求速得成就。
- 修習般若波羅蜜菩薩觀行念誦儀軌(不空譯)
