背景
到東京的琉球國使者琉球國曾多次遭受日本的入侵，1609年，薩摩藩入侵併在一個時期內控制琉球國北部，此時的琉球國仍然對中國朝貢。
吞併過程
日本學界將“吞併琉球”分為三個階段（時期），第一階段為琉球藩設定及出兵台灣時期，時間上為1872年—1874年；第二階段“廢藩置縣”，時間為1875年—1879年；第三階段為分島問題，時間上為1880年。日本學界將琉球藩設定為第一次琉球處分，廢藩置縣為第二次琉球處分。
第一次琉球處分
宮古島事件
1871年8月，明治政府下令廢藩置縣。同年，薩摩藩被廢除，改為鹿兒島縣。雖然琉球國是薩摩藩的附庸國，但其同時也是清朝的藩屬國。因此日本暫時沒有將琉球國吞併。
日本明治政府頒發的“琉球藩印”
同年11月，琉球國宮古島與那原村的謝敷築登之親雲上下屬的4艘進貢船，到那霸上繳年貢（人頭稅）後返回宮古島。途中遭遇颱風，其中一艘沉沒，一艘失蹤，一艘安全抵達宮古島，另一艘則飄到台灣南端的八瑤灣（今屏東縣滿州鄉境內）。船上人員有3名淹死，66名上岸。上岸的船員遭到排灣族高士佛社原住民襲擊，54人被殺出草。另有12人逃出，被漢族居民送往鳳山縣，由縣令送往福州柔遠驛安置。
設琉球藩
經過宮古島事件後，日本鹿兒島縣參事大山綱良提出了“台灣征伐論”，認為琉球既是日本的附庸國，日本應該假借懲治兇手的名義出兵台灣。但明治天皇認為琉球屬於中日兩屬狀態，此舉暫不合適。於是明治天皇在1872年密令大山綱良，以日本王政一新的名義，要求琉球遣使赴東京慶賀。同時慶賀使臣中不能有久米村人士（中國人的後裔）和親清派人士。尚泰王因此遣尚健（伊江王子朝直）、向有恆（宜灣親方朝保）前往東京慶賀。明治天皇召見了使臣後，頒布了詔書，改琉球國為琉球藩，並冊封尚泰為藩王，正式侵占琉球。
第二次琉球處分
中琉斷交
前往中國求援復國的琉球復國運動人士1、使用日本年號，廢止琉球對清朝朝貢和慶賀清帝即位而派遣使者的慣例，同時也廢除琉球國王更迭之際接受清朝冊封的慣例，以及琉球今後與清朝的交涉概由日本外務省管轄處分，撤銷在福州的琉球館，貿易業務由日本領事館管轄等。日本政府還命令琉球“藩王”入朝，研究政治釐革及興建之法。
2、將琉球納入日本版圖，強迫琉球和中國斷絕外交關係。
日本政府派遣松田道之到琉球，是因為此時明治政府已經將琉球劃歸內務府管理。1875年的這份命令，直接背景是大久保利通向明治政府提出的關於琉球的建議。1874年，在北京簽訂完《北京專條》的大久保利通，回日本後便向明治政府提出“今通過與清國之談判，彼承認我征藩地為義舉，並出銀兩撫恤受害難民，雖似足以表明琉球屬於我國版圖之實跡，但仍難說兩國分界業已判然”，為將來計，期望明治政府藉機斷絕琉球“與中國之關係，在那霸設定鎮台分營”。
琉球國被迫終止與清朝的外交關係。1876年，記載琉球國歷史的《中山世譜》、《球陽》的編撰也被迫停止。
廢藩設縣
1879年（清朝光緒五年、日本明治十二年）3月11日，琉球藩被廢除，編入鹿兒島縣。3月27日，日本內務省書記官松田道之率領41名內務官員，165名警部巡查隊和熊本鎮台分隊的兩個中隊600餘人至那霸港，向尚泰王傳達了廢除琉球藩的命令。3月30日，日本天皇命令將最後一位琉球國王尚泰和他的兒子尚典移居到東京，尚泰王稱病拒絕前往。
4月4日，日本在全國範圍宣布設立沖繩縣，鍋島直彬為沖繩縣知事。
5月27日，尚泰王與其他王室重要成員乘坐日本東海丸號離開那霸港，前往東京，被封為侯爵。
至此，琉球國滅亡。
