1932年，關東軍在中國東北炮製建立偽滿傀儡政權後，狂熱的陸軍軍人如石原莞爾、辻政信、片倉衷之流，便與右翼學者如作田莊一（京都大學教授）、平泉澄（東京大學教授）、筧克彥（東京大學教授）、西晉一郎（廣島文理大學教授）、波多野善大（後為名古屋大學名譽教授）等相結合，為培養其“滿洲建國”和“道義世界”建設的“人才”，而籌劃在偽滿“首都新京”（長春）建立該校。
1937年8月，頒布所謂“建國大學令”，並由偽滿“國務總理”張景惠任校長。但學校實際管理權操之於擔任副校長的日本人手中，先後擔任副校長的有作田莊一（1942年6月辭職)、尾高龜藏預備陸軍中將，1938年5月正式開學時，傀儡皇帝溥儀親臨發表“詔書”。
在1941年7月的任職教師中，日本人以外的教官只有9人，而日本教官則有71人。而在1941年3月，建大一年級第二學期在冊學生總數是126名，其中日本人60名，朝鮮人5名，台灣籍中國人1名，“滿人”（中國人）49名，蒙古人5名，俄羅斯人6名。
該校學制6年，在前期3年中，有所謂“精神訓練”、“軍事訓練”、“武道訓練”和“作業訓練”，日語教學亦占極大比重。在後期3年中，分為政治、經濟、文教三學科，但“神道及皇道”、“武道及武術論”、“民族協和論”、“東亞聯合及國際團體論”等課程則均在必修之列，都是為推行“日滿一體”乃至“大東亞共榮圈”而服務的。
1945年8月，隨著日本法西斯的戰敗投降和偽滿洲國的覆滅，這一偽國立大學也壽終正寢了。
