工程管理研究所的前身是土木工程系的施工教研組，2000年隨建
使命：
工程管理研究所以社會對建築業的需求為導向，致力於工程管理專業人才的培養、科學研究和諮詢服務，從綠色建築與建設項目全壽命管理、建築市場與行業公共政策、建設信息管理等多角度，為人類共同的可持續未來，為中國建設市場的健康發展，為實現清華大學創建國際一流大學的發展目標，貢獻出自己的力量。
教學：
研究所在“管理科學與工程”一級學科領域，現有教授1人、副教授2人、講師1人。本所培養碩士和博士研究生，招收博士後，提供的主題課程包括：工程項目管理、建築施工組織、工程契約管理、建築經濟、運籌學、建築工程信息管理技術、建設工程擔保、建築市場交易與行業規制、工程管理英語和建管課程綜合設計。
學術研究：
工程管理研究所成立以來，先後承擔的項目包括國家自然科學基金項目、國家重大科技攻關項目、省、部委委託項目、企業委託項目及國際合作項目，如世界銀行、亞洲開發銀行、透明國際、美國建築業研究院項目。研究所教師出版了《建築施工》、《新建築經濟學》等多本教材和專著，在SCI、EI學術期刊上發表了大量高質量的學術論文。主要研究領域包括：工程項目與建築施工管理、綠色施工、建設項目環境影響評價、建築經濟學、建築市場與行業公共政策、建設領域反腐敗、建築企業管理、建設信息管理和建築產品整體性。
