歷史沿革
2000年，浙江工業大學藥學院開始組建，與化工學院兩塊牌子、一套班子運行。
2001年11月28日，浙江工業大學藥學院正式掛牌成立。
學院成立2001年9月，浙江工業大學任命藥學院黨政班子，任命張如松為藥學院第一任院長。11月28日，時任浙江工業大學校長沈寅初院士、黨委書記汪曉村為學院揭牌，中國科學院上海藥物研究所陳凱先院士、中國科學院上海生物化學研究所洪國藩院士、上海醫藥工業研究院周后元院士等嘉賓參加了揭牌儀式。
2002年，學院“製藥工程”工程碩士專業學位授權點獲批；浙江省製藥工程重點實驗室獲批；新增藥學本科專業，並開始招生。
2003年，學院藥物化學、微生物與生化藥學2個碩士專業開始招生，製藥工程專業獲批為省級重點建設專業。
2004年10月，由學院藥物化學學科牽頭，與浙江中醫學院、浙江省醫科院、浙江省藥品檢驗所和浙江大學藥學院聯合成立了浙江省第一個“新藥創製科技服務平台”。
2005年，學院浙江省製藥重中之重學科獲批。
學院活動2006年，學院藥物化學博士點、藥學一級學科碩士點獲批，下設6個二級學科碩士點。
2007年，學院藥物化學學科首次獲得國家“十一五”計畫1項；12月，蘇為科教授團隊完成的“替代光氣、氯化亞碸等有毒有害原料的綠色化學技術開發及推廣套用”項目獲國家技術發明二等獎，這是浙江工業大學獲得的第13項國家科學技術獎。
2008年，學院新增中藥學本科專業，並開始招生；蘇為科教授當選為浙江省特級專家，成為浙江工業大學第四位浙江省特級專家。
10周年慶典活動2009年，學院製藥工程專業獲批為國家第四批高等學校特色專業建設點；浙江省製藥工程技術創新團隊被確定為浙江省高等學校創新團隊。
2010年，浙江工業大學首個浙江省工程實驗室“綠色製藥工程實驗室”，獲得浙江省發改委授牌成立。
2011年，學院綠色製藥技術與裝備教育部重點實驗室正式獲批；綠色製藥工藝科技創新團隊被確定為第二批科技創新類“浙江省重點創新團隊”；新增“藥學”專業學位碩士授權點，並開始招生。
2013年，依託學院申報的“長三角綠色製藥協同創新中心”入選首批國家“2011計畫”。
2015年12月，學院藥學學科成為浙江省一流學科建設學科（A類）。
辦學條件
專業設定
根據學院2016年6月官網顯示，學院有製藥工程（含化學製藥和生物製藥兩個方向）、藥物製劑、藥學、中藥學4個本科專業。
| 專業名稱 | 專業代碼 | 學制 | 授予學位類別 |
| 製藥工程 | 081302 | 四年 | 工學 |
| 藥物製劑 | 100702 | 四年 | 理學 |
| 藥學 | 100701 | 四年 | 理學 |
| 中藥學 | 100801 | 四年 | 理學 |
| 資料來源： | |||
師資力量
學術交流根據學院2016年6月官網顯示，學院有教職工102人，正高級職稱教師31人，副高級職稱教師39人，具有博士學位教師62人，博士生導師24人，碩士生導師68人。有享受政府特殊津貼、浙江省特級專家、浙江省有突出貢獻中青年專家1人，教育部新世紀人才1人，“錢江學者”特聘教授2人，浙江省“千人計畫”入選者3人，浙江省高校中青年學科帶頭人7人，浙江省“新世紀151人才工程”人選24人。
享受政府特殊津貼、浙江省特級專家、浙江省有突出貢獻中青年專家： 蘇為科
浙江省高校中青年學科帶頭人：蘇為科、王普、崔冬梅、顏繼忠、占扎君、熊素彬、童勝強
浙江省“千人計畫”入選者：張逢質、阮奔放、張文（創業型）
“錢江學者”特聘教授：李慶勇、張逢質
浙江省新世紀151人才第一、二、三層次人選：錢俊青、蘇為科、王平、鍾為慧、王鴻、謝媛媛、李堅軍、崔冬梅、顏繼忠、王普、陳志衛、 應國清、楊勝利、楊根生、林陳水 、張興賢、劉迎新、石浩 、占扎君 、于海寧 、馮海 、饒國武
教學建設
根據學院2016年6月官網顯示，學院有1個國家高等學校特色專業，1個浙江省優勢專業，1個浙江省新興特色專業，1個浙江省優勢專業，1項浙江省級教改項目，4門校級精品課程。
國家高等學校特色專業：製藥工程
浙江省重點專業：製藥工程
浙江省優勢專業：製藥工程
浙江省新興特色專業：藥物製劑
浙江省級教改項目：
| 年份 | 負責人 | 項目名稱 | 項目類型 |
| 2005 | 單偉光 | 新形勢下高校藥學專業畢業環節的改革與實踐 | 省教育廳新世紀教改 |
| 資料來源： | |||
精品課程：
| 年份 | 負責人 | 名稱 | 項目類型 |
| 2008 | 王普 | 《微生物製藥學》 | 校精品課程 |
| 2008 | 顏繼忠 | 《化學製藥工藝學》 | 校精品課程 |
| 2009 | 應國清 | 《生化分離工程》 | 校精品課程 |
| 2010 | 單偉光 | 《藥物分析》 | 校精品課程 |
| 資料來源： | |||
教學成果：
| 年份 | 負責人 | 名稱 | 獎項 |
| 2010 | 顏繼忠 | 開放式實驗教學模式的研究與實踐 | 校教學成果獎二等獎 |
| 2010 | 王普 | 製藥工程浙江省重點專業建設的探索與實踐 | 校教學成果獎二等獎 |
| 資料來源： | |||
學科建設
根據學院2016年6月官網顯示，學院有浙江省重中之重一級學科1個，浙江省重點學科2個，浙江省一流學科建設學科（A類）1個，1個二級學科博士點，6個二級學科碩士點，2個專業學位碩士點。
浙江省重中之重一級學科：藥學
浙江省重點學科：中藥學、化學生物學
浙江省一流學科建設學科（A類）：藥學
博士學位點：
| 序號 | 學位點名稱 | 授權時間 | 招生時間 | 學科層次 |
| 1 | 藥物化學 | 2005 | 2006 | 二級學科 |
| 資料來源： | ||||
碩士學位點：
| 序號 | 學位點名稱 | 授權時間 | 招生時間 | 學科層次 |
| 1 | 藥物化學 | 2002 | 2003 | 二級學科 |
| 2 | 微生物與生化藥學 | 2002 | 2003 | 二級學科 |
| 3 | 藥理學 | 2006 | 2007 | 二級學科 |
| 4 | 藥物分析 | 2006 | 2007 | 二級學科 |
| 5 | 藥劑學 | 2006 | 2007 | 二級學科 |
| 6 | 生藥學 | 2006 | 2007 | 二級學科 |
| 7 | 製藥工程 | 2002 | 2002 | 專業學位 |
| 8 | 藥學 | 2010 | 2011 | 專業學位 |
| 資料來源： | ||||
學術科研
科研平台
根據學院2016年6月官網顯示，學院有國家“2011計畫”1個，教育部重點實驗室1個，國家工程技術研究中心1個，浙江省協同創新中心1個，浙江省級科研平台6個，浙江省重點創新團隊1個，浙江省高等學校創新團隊1個，5個校級研究所。
國家“2011計畫”：長三角綠色製藥協同創新中心
教育部重點實驗室：綠色製藥技術與裝備教育部重點實驗室
國家工程技術研究中心：國家化學原料藥合成工程技術研究中心
浙江省協同創新中心：綠色製藥浙江省協同創新中心
浙江省級科研平台：浙江省新藥創製科技服務平台、浙江省製藥工程重點實驗室、綠色製藥浙江省工程實驗室、浙江-俄羅斯機械化學聯合實驗室、浙江省中藥現代化產業技術創新戰略聯盟、浙江省化學藥製劑產業技術創新戰略聯盟
浙江省重點創新團隊：綠色製藥工藝科技創新團隊
浙江省高等學校創新團隊：浙江省製藥工程技術創新團隊
校級研究所：綠色化學製藥技術研究所、藥物合成工藝研究所、機械化學研究所、生物製藥研究所、新藥開發研究所、生藥與天然藥物研究所、藥物分析研究所、藥物製劑研究所、藥理研究所、中藥研究所
科研成果
•科研項目
根據學院2016年6月官網顯示，學院承擔的國家級及省部級科研項目150餘項。
| 項目名稱 | 類別 |
| 金絲桃素分子烙印聚合物膜的製備及其分子識別機制研究 | 國家基金面上項目 |
| 基於離子液體共溶劑的反應體系構建及微生物催化合成手性含氟芳基仲醇的套用基礎研究 | 國家基金面上項目 |
| 基於Baylis-Hillman反應的手性膦杯芳烴的合成及催化性能研究 | 國家基金面上項目 |
| 基於機械力活化理論的氯代芳烴固態Heck反應研究 | 國家基金青年基金 |
| 黃花蒿內生麴黴來源的腫瘤細胞多藥耐藥ardeemins類逆轉劑研究 | 國家基金青年基金 |
| 機械力促進的不活潑鹵代芳烴參與的碳雜偶聯反應研究 | 國家基金面上項目 |
| 空心球形介孔碳負載貴金屬雙功能催化劑的創製及其催化性能研究 | 國家基金青年基金 |
| 膜活性肽強化多功能複合微粒基因載體的構建及細胞內控釋行為研究 | 國家基金青年基金 |
| 多重雙相洗脫與雙相識別模式在逆流色譜手性分離中的套用基礎研究 | 國家基金青年基金 |
| 資料來源： | |
•科研獲獎
根據學院2016年6月官網顯示，獲得國家技術發明二等獎1項，中國石油和化學工業協會科技進步一等獎5項，省部級科技進步獎17項。
| 成果名稱 | 獲獎獎項 |
| 雜環類新型抗癌藥物的合成及其構效關係的研究 | 浙江省教育廳科技進步三等獎 |
| 高效液相色譜法分離手性化合物光學異構體的研究 | 浙江省教育廳科技進步三等獎 |
| 廢棄農產資源潔淨髮酵生產飼料蛋白及其他利用技術 | 浙江省教育廳科技進步三等獎 |
| 1-乙醯基-2-咪唑烷酮的研製與開發 | 浙江省科學技術獎二等獎 |
| 低壓液相催化加氫綠色合成技術套用 | 教育部提名國家科學技術獎二等獎 |
| 催化綠色合成技術套用研究及推廣 | 浙江省科學技術獎三等獎 |
| 間苯二胺綠色製備工藝研究及套用推廣 | 中國石油和化學工業協會科學技術獎一等獎 |
| 替代光氣、氯化亞碸等有毒有害原料的綠色化學技術開發及推廣套用 | 中國石油和化學工業協會科學技術獎一等獎 |
| 替代光氣、氯化亞碸等有毒有害原料的綠色化學技術開發及推廣套用 | 浙江省科學技術獎一等獎 |
| 三氟苯系列產品技術開發及產業化 | 中國石油和化學工業協會科學技術獎一等獎 |
| 替代光氣、氯化亞碸等有毒有害原料的綠色化學技術開發及推廣套用 | 國家技術發明獎二等獎 |
| N-[1(S)-乙氧羰基-3-苯丙基]-L-丙氨酸-N-羧酸酐的化學合成方法 | 第十屆中國專利獎優秀獎 |
| 卡馬西平、奧卡西平綠色合成技術開發及產業化 | 中國石油和化學工業協會科學技術獎一等獎 |
| 非甾體類抗炎新藥酮咯酸氨丁三醇的研發及產業化 | 省科學技術獎三等獎 |
| 卡馬西平、奧卡西平綠色合成技術開發及產業化 | 浙江省科學技術獎一等獎 |
| 萘普生綠色合成技術開發及產業化 | 中國石油和化學工業聯合會科學技術獎一等獎 |
| 2-氯-5-三氟甲基苄醇產品技術開發及產業化 | 中國石油和化學工業聯合會科學技術獎二等獎 |
| 第二代大環內酯藥物的綠色合成技術開發及產業化套用 | 中國石油和化學工業聯合會科學技術獎二等獎 |
| 甲乙型流感病毒（Flu A/B）檢測試劑盒（膠體金法） | 省科學技術獎二等獎 |
| S-四嗪二甲醯胺抗肺癌作用及其機制的體外研究 | 省科學技術獎三等獎 |
| 利巴韋林製造集成技術開發及工程化 | 中國石油和化學工業聯合會科學技術獎二等獎 |
| 氮肥緩釋劑-正丁基硫代磷醯三胺的綠色合成工藝研究及產業化 | 中國石油和化學工業聯合會科學技術獎三等獎 |
| 萘普生綠色合成技術開發及產業化 | 浙江省科學技術獎一等獎 |
| 抗病毒藥物關鍵中間體DACV的綠色合成技術開發及產業化 | 浙江省科學技術獎三等獎 |
| 資料來源： | |
•論文發表
根據學院2016年6月官網顯示，學院發表三大索引學術論文600餘篇，出版專著3部，已授權發明專利398項。
| 類別 | 2008 | 2009 | 2010 |
| 三大索引 | 62 | 69 | 70 |
| 核心刊物 | 36 | 55 | 39 |
| 一般刊物 | 8 | 2 | 5 |
| 資料來源： | |||
文化傳統
•院訓
天人合一，循理精煉
學院活動釋義：“天人合一”是中國的一種傳統思想，源於《易·乾卦·文言》。“天”有三種涵義：一指最高主宰，二指廣大自然，三指最高原理。“天人合一”的含義為宇宙觀上的人與自然的統一；倫理觀上的天道與人道的統一和藝術觀上的景與情的統一，就是力圖追求天與人的相通之處，以求天人協調，和諧與一致。“天人合一”蘊含物我一體、人天同構的深刻的科學思想，已成為當代人類社會追求科學精神與人文精神相結合的先進理念。
“循理”就是依照事物運動變化的固有秩序和規律、人類社會的道德原則和規範、事物的本質和本性。“精煉”就是不斷地堅持不懈地提純、加工、改造，使之精益求精，至善至美。把“天人合一，循理精煉”作為藥學院的院訓旨在把科學精神與人文精神結合起來，把理論與實踐結合起來，把傳統文化與現在文明結合起來，發展醫藥科學技術，為人類的福祉而不斷追求至真至善至美。
•院徽
院徽釋義：標誌以青黴素分子的結構為基本形，以藥學英文單詞首個字母“P”為主框架，體現藥學院的特徵。用菱形代替圓球形成鏈狀結構，使標誌更為穩重，賦於形體感，象徵了學院發揚原工科的良好基礎，扎紮實實做好每一步，趕超國內外先進，達到更高的水平。標誌整體形成一個向右上的箭頭，代表學院蒸蒸日上，擁有蓬勃生機，套用菱形的大小漸變和前傾的趨勢表明了學院一步一個腳印的向前邁進。綠色象徵著人與自然的和諧統一，藍色象徵著科學和理性。
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 院長 | 蘇為科 |
| 黨委書記 | 肖春 |
| 副院長 | 鍾為慧、王鴻、 謝媛媛 |
| 黨委副書記 | 姚鵬 |
| 資料來源： | |
知名校友
白驊，浙江海正藥業股份有限公司董事長兼總經理，浙江海正集團有限公司黨委書記。
金敬德，浙江仙琚製藥股份有限公司董事長、總經理、黨委書記。
方岳亮，康恩貝集團有限公司董事、副總裁、黨委書記。
許士炎，浙江康寧醫藥有限公司總經理。
汪少華，杭州珍誠醫藥有限公司總經理。
陳保華，浙江華海藥業股份有限公司董事長兼總經理。
姚建龍，雲南康恩貝生物谷發展有限公司執行總經理。
方南平，浙江昂利康製藥有限公司董事長兼總經理。
呂春雷，浙江醫藥股份有限公司副總經理。
