主要著作
沈老照片《溫病概要》，《臨床實用中醫方劑學》，《新經驗方》等。曾在國內中醫雜誌上發表論文，評述，醫話和醫案一百多篇。 內容簡介
本論文集收集了沈老自1923年~1949年前的近300篇學術論文。大致分為三部分。
一、基礎性研究論文。沈老的文章多以短小精悍為主，重視在社會中即時發現與中醫相關的各類問題。
二、臨床研究性論文，在沈老的臨床研究性論文中，既有臨床診病的經驗、體會，更有相當論文涉及傳染病的潛伏、隔離、治療的內容。沈老還有針性地寫了大量的中醫藥防治疾病的科普文章。
三、其他論文，主要是醫話、隨筆、序文及書信往來等內容。這些雜文不可小視，常有畫龍點睛之論。
學術思想
著作圖沈仲圭主張理論與實踐相結合，傷寒與溫病相統一。他說，讀書是掌握理論知識，臨證是運用理論指導實踐。沒有基本理論作為實踐的根本，輒爾懸壺，以人命為嘗試，則難免誤診誤治。反之，有了一定的理論而沒有實踐經驗，紙上談兵，也易誤事。理論與實踐是一個反覆循環、不斷提高的過程，要不斷總結臨床經驗，包括失敗的教訓。醫學理論必須時時和臨床相印證，體會才能深刻。如他認為《溫病條辨?上焦篇》十八條所云“溫毒咽痛喉腫，耳前後腫，頰腫，面正赤，或喉不痛但外腫，甚則耳聾，俗名大頭溫、蝦蟆溫者，普濟消毒飲去柴胡、升麻主之。初起一、二日，再去芩連，三、四日加之佳”一句，吳氏用普濟消毒飲為何如此加減？蓋因病在上焦，故減去升麻、柴胡升提之品；發病一、二日去大苦大寒之芩連，以免引邪入里；三、四日後內熱之邪轉盛，再加入芩連以清內熱。總之，理論學習的目的在於提高臨床療效。
沈仲圭認為傷寒、溫病本是一體，不應另立門戶。溫病學說是在《內經》、《難經》、《傷寒論》的基礎上發展起來的，既能補充《傷寒論》的不足，又與《傷寒論》互為補充，使外感病的治療更為完善。
臨床經驗
著作圖對於門脈性肝硬化腹水（即臌脹）的治療，沈仲圭認為用泄水峻劑，如大戟、芫花、甘遂之類，雖能水去腹小，但不久又復膨脹，反覆施用，元氣大傷，終至不救。故治此症必須“和肝補脾”，殊為切當。沈仲圭還曾用贊化血餘丹治癒陽痿一例。患者李某，廣西梧州某廠工人，患陽痿已數年，伴有腰酸腿軟，心悸失眠等症，來信要求處方。沈仲圭認為繫心腎兩虧，擬贊化血餘丹加減，並改為湯劑。患者服用月余，諸症消失。贊化血餘丹，方用血餘、熟地各24克，首烏（牛乳拌蒸）、核桃肉、蓯蓉、茯苓、小茴香、巴戟、杜仲、菟絲子、鹿角膠（炒珠）、當歸、枸杞各12克，人參6克。照方十倍量，煉蜜為丸，每丸9～15克，飯前服。功能補氣血，烏鬚髮，壯形體。此方補而不峻，滋而不膩，有補氣血、益肝腎之效。 沈仲圭精於治療溫病及虛證，善用補虛之法，並擅長對中醫方劑的研究。如他對虛勞咳血形瘦便溏的治療，自擬清肺保金、扶元培土、益陰平肝之劑。藥用西洋參3克、麥冬9克、燕窩6克、冬蟲夏草9克、阿膠10克、百合12克、山藥15克、川貝6克、甜杏仁6克、款冬花6克、生地炭20克、瓊玉膏一匙，療效尤佳。對於方劑的加減運用，他強調臨床選方要準確，方劑加減要得當，務必謹守病機，靈活變通，加減不能無則，亦須避免照搬成方。漫無邊際的加減，每致原方功能改變，輕者影響療效，重則轉為危候。比如仲景桂枝湯，本為解肌發表、調和營衛之劑，是治療太陽中風的專方。若倍芍藥加飴糖，即成為溫中補虛、和里緩急的小建中湯，再用於太陽中風證何能取效？當然照搬成方，療效亦不會高，因同患一種病，由於體質強弱，年齡大小，患病時間長短以及性別、環境、生活習慣等方面的原因，所現症狀不盡相同，用藥也就有別。當然，若逢病情與方劑所主病證完全相符，那也就不必加減了。
後世影響
沈仲圭熱心於中醫教育事業，理論造詣頗深，臨床經驗豐富。從其學者，往往獲益良多。正如已故著名中醫學家任應秋曾說：“沈仲圭老先生是一位難得的中醫專家。”
