建築布局
1999年—2007年博物館基本陳列為《汶上出土文物通史陳列》、《太子靈蹤塔宮佛教聖物展》、《石刻拓片展》等系列;2007年我縣對博物館展廳進行高標準設計調展,基本陳列為《文明曙光》、《教化中都》、《佛教傳入》、《同朝四尚書》、《運河樞紐》、《塔宮聖物》等系列,陳列面積1000多平方米。
館藏文物
目前館藏文物2000餘件,其中國家一、二、三級文物近百件,上迄更生世第四紀新生代古棱齒象牙化石,下至近、現代文物,尤其是1994年3月15日太子靈蹤塔出土的佛牙、舍利、金棺、銀槨等佛教至高無上的聖物成為館藏文物的一大特色。