曼日寺創立者雍仲本教第二佛陀良美大師曼日寺寺廟駐地海拔4700米，依山而建，高寒缺氧。歷史上，該寺分有上、中、下、邊4個分寺及若干個康贊。曾有楚、修、欣、巴、謬、瓊六大氏祖傳十六大法王，33代堪布主持。寺內供有以二世法王西饒堅贊的靈塔為代表的眾多歷史文物。主要宗教活動有每年逐月要舉行29日法會和15日祈禱法會，在“竹布康”藏曆每月舉行了一次護法神祈禱法會，稱之為“十二竹巴”法會。 目前，曼日寺仍然香火不斷，是當今後藏地區頗有影響的一座本波教重要寺院。
約於公元一四零五年，良美大師來到此處，重建溫薩寺，取名為扎西曼日寺。據該師傳記所言：良美大師既是第十八位授教師仁青羅珠的弟子，也是文殊菩薩的化身。
曼日寺有四大學院以及十二大康村，常住的僧人約有五百多名僧人，並且來自各地的多數僧人集在該寺，學習佛法。他們的學習內容是，以五部理論為代表的顯宗法門，四部理論為核心的密宗勝法，還有心識部、法界部和竅決部為主體的大圓滿。照此而言：該寺圓滿具備了顯密大圓滿並行之修法，此外還有宗教及民族的傳統文化。
學習方式簡介如下：首先通過聞、思二慧的方式去了解顯密各自的含義，然後通過修慧來加以修持，等精通顯宗五部理論、四部密宗、三部大圓滿以及大小五明學科，將得到格西學位。
良美大師有云：“佛法根基為戒律，佛法精髓為密宗，佛法極頂是大圓滿，明燈為講修”。這四句影響了整個本教信眾，使每個本教寺廟都有聽聞以及修持正法佛法之方法。他們通過講、辮、著作三者維持佛法、弘揚佛法，在他們心中將把曼日寺當作法場中心。因此曼日寺後來出世的諸歷代上師都成為所有本教的極頂莊嚴，並為本教法王。
