機構設定
圖書館實行校長領導下的館長負責制。學校設有圖書館工作委員會，分管校長任主任，館長任副主任，學校重要部、處、室領導和各院系領導或師生任委員。館內設有圖書館館務委員會、圖書館文獻資源建設委員會、圖書館自動化建設委員會等。
學校圖書館設館長1名、副館長2名。日照校區圖書館設館長1名、副館長1名。
基礎設施
截止2014年，學校圖書館建築面積16092平方米，。日照校區圖書館建築面積26796平方米，閱覽座位2616個。兩校區圖書館建築面積總計4萬餘平方米，閱覽座位4824個，此外，實驗樓A區一層被劃為新的閱覽專區，基本上能滿足學校教學、科研的需要。
圖書館的網路分內、外兩網。兩校區各自的內部區域網路使用卓有成效的自動化管理系統。兩校區館的網路通過教育網相連，實現了兩處文獻資源的共知、共享。
文獻資源建設
積極開展數字資源建設和網路虛擬資源建設，整合了實體資源與虛擬資源，形成了科學的館藏體系。
到2014年兩校區館館藏紙質文獻53.61萬種、250.5萬冊，中外文資料庫26個，另有大量的多媒體文獻，生均文獻量超過105冊；數字資源量不斷取得穩步增長，電子圖書達到5722G，電子期刊2477G，光碟量9431G。2008年圖書文獻資料購置費487萬元，2009年圖書文獻資料購置費529.8萬元，年進書量超過12萬冊，生均年進書量超過4冊。館藏文獻總量、年進文獻量及生均冊數達到“普通高等學校基本辦學條件指標合格標準”。
業務管理
圖書館管理手段先進，能確保各項工作的有效開展。
1、堅決貫徹執行教育部下發的《普通高等學校圖書館規程（修訂）》檔案，認真貫徹國家的教育方針。積極採用現代技術，實行科學管理，不斷提高業務工作質量和服務水平，為學校的教學和科學研究提供切實有效的文獻信息保障。
2、注意管理方法，努力提高了圖書館的業務和行政管理水平。
樹立“讀者第一，服務育人，親情服務”的宗旨，緊緊圍繞著“一切為了讀者，為了讀者的一切”中心思想開展工作。
為便於工作的科學管理和有效開展，學校對圖書館實行按需設崗，對所有工作人員進行了職務、職稱聘任。
完善管理措施，建立健全各項規章制度，制定業務工作規範，明確崗位職責，規定考核辦法。通過修訂《圖書館崗位職責》、，制定《圖書館崗位考核標準》，實施了業務科學化、標準化、制度化管理，保證了圖書館各業務流程規範、有序，保證了圖書館各項工作的順利開展。
完善業務和行政組織機構，成立了以下組織機構：圖書館館務委員會、館工會委員會、館學術委員會、館文獻信息資源建設委員會、館數位化建設委員會等。
為了提高服務水平和服務質量，積極進行職工的業務培訓和技能培養。
在開展“依法治館”的同時，積極進行“以德治館”，營造圖書館的人性化氛圍，創造圖書館發展的最佳環境。
加強與讀者的溝通，建立起通暢的溝通渠道，設立意見箱、網上留言板，定期開展讀者與圖書館工作人員的對話制度；各服務部門設立“讀者服務監督台”加大讀者對圖書館工作的監督力度。
圖書館根據業務內容和流程，把業務工作分為組織協調管理、文獻資源建設、文獻分類編目、文獻典藏、文獻流通閱覽、文獻保存管理、數字文獻加工、信息諮詢服務、管理系統及軟、硬體維護、資料庫研製開發、網路文獻發布等。
根據國家的相關規定，實現了文獻信息資源加工、組織和管理的標準化、規範化。
圖書館十分注意目錄體系的建設，建立了完善的文獻信息檢索系統，滿足了用戶的多途徑檢索的需求。加強對書目資料庫的管理和維護，保證數據與資源的一致性。
為方便讀者，更好地發揮圖書館的服務功能，圖書館在館內設立了“複印室”、“書店”、“視聽室”、“裝訂室”、“電話室”等部門。圖書館儘可能地延長了閱覽時間。每周對外開放時間達到98小時，網上資源做到了24小時開放。
圖書館在兼顧紙質文獻、電子文獻和其它載體文獻流通閱覽的同時，積極推廣紙質文獻的開架借閱、電子資源上網服務、多媒體閱覽服務等。積極開展網上預約、催還和續借服務，網上館際互借和文獻傳遞服務，網上電子公告、電子論壇和意見箱服務，網上信息資源導引服務，最新信息定題通告服務，網上協同信息諮詢服務等網路服務。
通過編制推薦書目、導讀書目，舉辦書刊展評等多種方式進行閱讀輔導，通過開設文獻信息檢索與利用課、新生入館教育課、面向讀者的各種講座以及其它多種手段，對讀者進行信息素質教育。積極開展參考諮詢、文獻信息定題檢索、課題成果查新、信息編譯和分析研究、最新文獻報導等信息服務工作。
另外，還積極組織特色文獻的服務，充分發揮特色文獻的優勢，加快特色文獻的數位化建設。曲阜師大館現有十幾萬冊的古籍文獻和豐富的儒學文獻，對保證全國高校中唯一的“儒學研究基地和碩士點”建設起著重要的作用。
數位化建設
圖書館特別是校區圖書館對所有館舍進行了網路綜合布線，千兆光纖連線兩校區，百兆交換到桌面，實現了跨校區部分資源的共知、共建、共享。
圖書館對各類文獻的管理、對讀者開展的現代化服務主要藉助一套機群、15台伺服器、一套15T磁碟陣列和560台微機進行的。
圖書館數位化建設的平台是清華大學的TPI管理系統。文獻採訪、編目的數據主要來源於要求書商提供的MARC數據、CALIS中心的在線上編目數據。
圖書館在每校區擁有一個電子閱覽室。電子閱覽室的新機器利用率在100%，舊機器利用率也在60%以上。
圖書館借用現代化手段和設施，積極開展數位化服務，建設數據化資源。現已購置大型資料庫26個，自建資料庫6個以上。
為了加強圖書館與讀者的溝通，加大圖書館數位化資源及服務的推介力度，促進廣大師生適應圖書館現代信息服務方式的轉變。從2006年開始，連續幾年成功舉辦“數位化服務宣傳周”活動。活動通過舉辦講座、資料庫演示、現場諮詢、讀者問卷調查等方式展開，取得預期的良好效果。
圖書館數位化建設的目標就是實現曲阜師大館由傳統型向數字型的根本性轉變。
對外交流
圖書館目前有正式職工124名，95%以上有大學學歷，知識結構、職稱結構、年齡結構合理，開拓進取意識強、科研實力強。職工中有教授3人，研究館員5人，副研究館員26人，館員65人。
圖書館十分重視結合實際的學術研究和學術活動，積極舉辦各級別的學術會議，積極申報各級各類科研課題並取得了顯著的成績。2000年以來，公開發表學術論文700餘篇，出版著作20餘部，獲省、市、校級獲勵20餘次，申報各類科研課題20餘項，在圖書館學術界有一定的聲譽和知名度。
圖書館多次承擔國家和本省的專業培訓或行業會議，如受國家教委委託、主辦“世界銀行貸款師範項目培訓班”、“山東省高校圖書館館長會議”、“華東地區省屬重點師範大學圖書館館長協作會”等。
圖書館還把對外交流工作放到很重要的地位。交流活動，使我們受益頗多，既開闊了眼界，又學到了許多先進的管理經驗，對事業的發展意義深遠。
文化氛圍建設
曾經開展的工作主要有：與相關部門聯合舉辦“杏壇讀書節”；請校內外名家做學術報告、專題講座；進行有獎徵文，開展學術沙龍活動，做好圖舉辦高水平的演講、歌詠、徵文比賽；成立專業性強、與讀者溝通好的社團組織——讀書俱樂部；提高館報——《讀書做人報》的辦報質量和品味；辦好影響較大的“圖書館文化信息之窗”；配合學校教學做好圖書館影視作品的放映工作；搞好圖書館館舍的文化裝飾等。
圖書館還充分利用有限的空間，提高師生的文化修養和藝術修養，不定期舉辦健美操、文藝晚會、演唱比賽。
文體活動
除每年舉辦職工文藝晚會外，還積極參加學校或社會組織的各類比賽或活動，如學校運動會、球類比賽、操類比賽、歌詠比賽、長跑比賽、文藝會演等，並取得不錯的成績，先後獲得各級獎勵幾十次，受到學校的多次表彰。
