似然比 = L(r)/ L(1/2)
L(r):假設兩個標記間以r的重組率相連鎖的機率;
L(1/2):假設兩個標記間為非連鎖的機率。
Linkage test (連鎖檢驗):
L(r)
LOD = log ------------
L(1/2)
LOD為L(r)/ L(1/2)取以10為底的對數。
在實際套用技術中,要求似然比L(r)/ L(1/2)大於1000:1,即LOD>3.0,才能證實這兩標記間存在連鎖。即
LOD = log L(r)/ L(1/2)
= log 1000
=3.0
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