彭新林先後在《中國法學》、《法學研究》等核心以及專業刊物上發表學術論文70餘篇,出版《酌定量刑情節限制死刑適用研究》、《腐敗犯罪案件程式問題要論》等專著3部,合著、參編、副主編、合譯書籍20餘部,主持國家社科基金項目、國家法治與法學理論研究部級項目、中國博士後科學基金特別資助項目等課題多項。
研究領域包括刑法學、刑事訴訟法學、政治學等學科,特別是在反腐敗、死刑改革、司法改革等領域成績斐然,推出了一系列標籤性的學術成果,在理論界與實務界產生了廣泛影響。 他提出的“構建中國特色前科消滅制度”的學術成果和思想,曾在理論界和實務界引起較大反響,曾被中國法學會《法學文摘》2007年26期專題摘錄並以內參形式報送中央政法委員會書記、副書記、秘書長暨中央政法委員會、國務院法制辦、中央軍委法制局、最高人民法院、最高人民檢察院等中央政法領導機關參考,並引起重視。以此為契機,2008年年初,中央政法委即派出調查工作組專程到四川省彭州市調研少年犯“前科消滅”試行工作情況,對四川彭州試行“前科消滅”制度給予了充分肯定。